Novel proteases from the genome of the carnivorous plant Drosera capensis: Structural prediction and comparative analysis.

Butts, Carter T; Bierma, Jan C; Martin, Rachel W

Butts, Carter T; Bierma, Jan C; Martin, Rachel W.

Afiliação

Butts CT; Department of Electrical Engineering and Computer Science, UC Irvine, Irvine, California, 92697. rwmartin@uci.edu.
Bierma JC; Department of Statistics, UC Irvine, Irvine, California, 92697. rwmartin@uci.edu.
Martin RW; Department of Sociology, UC Irvine, Irvine, California, 92697. rwmartin@uci.edu.

Proteins ; 84(10): 1517-33, 2016 10.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-27353064

Assuntos

Carnivoridade/fisiologia; Drosera/genética; Droseraceae/genética; Genoma de Planta; Peptídeo Hidrolases/química; Proteínas de Plantas/química; Sequência de Aminoácidos; Domínio Catalítico; Mapeamento de Sequências Contíguas; Drosera/classificação; Droseraceae/classificação; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala; Simulação de Acoplamento Molecular; Anotação de Sequência Molecular; Peptídeo Hidrolases/genética; Peptídeo Hidrolases/metabolismo; Filogenia; Proteínas de Plantas/genética; Proteínas de Plantas/metabolismo; Domínios Proteicos; Dobramento de Proteína; Estrutura Secundária de Proteína; Alinhamento de Sequência; Homologia Estrutural de Proteína; Especificidade por Substrato

Palavras-chave

Rosetta; aspartic protease; carnivorous plant; cysteine protease; digestive enzyme; enzyme substrate specificity; genome sequence; molecular docking; plant-specific insert; protein structure prediction

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Peptídeo Hidrolases / Proteínas de Plantas / Genoma de Planta / Drosera / Droseraceae / Carnivoridade Tipo de estudo: Prognostic_studies / Risk_factors_studies Idioma: En Ano de publicação: 2016 Tipo de documento: Article

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