Prediction of kinase-specific phosphorylation sites through an integrative model of protein context and sequence.

Patrick, Ralph; Horin, Coralie; Kobe, Bostjan; Cao, Kim-Anh Lê; Bodén, Mikael

Patrick, Ralph; Horin, Coralie; Kobe, Bostjan; Cao, Kim-Anh Lê; Bodén, Mikael.

Afiliação

Patrick R; School of Chemistry and Molecular Biosciences, The University of Queensland, St Lucia 4072, Australia. Electronic address: r.patrick@uq.edu.au.
Horin C; Polytech Nice-Sophia, Université Nice Sophia-Antipolis, Nice 06103, France.
Kobe B; School of Chemistry and Molecular Biosciences, The University of Queensland, St Lucia 4072, Australia; Institute for Molecular Bioscience, The University of Queensland, St Lucia 4072, Australia; Australian Infectious Diseases Research Centre, The University of Queensland, St Lucia 4072, Australia.
Cao KA; The University of Queensland Diamantina Institute, Translational Research Institute, Woolloongabba, QLD 4102, Australia.
Bodén M; School of Chemistry and Molecular Biosciences, The University of Queensland, St Lucia 4072, Australia; Institute for Molecular Bioscience, The University of Queensland, St Lucia 4072, Australia.

Biochim Biophys Acta ; 1864(11): 1599-608, 2016 11.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-27507704

Assuntos

Aurora Quinase B/genética; Proteínas Quinases Dependentes de AMP Cíclico/genética; Modelos Estatísticos; Fosfoproteínas/genética; Proteínas Quinases/genética; Proteínas Proto-Oncogênicas c-akt/genética; Sequência de Aminoácidos; Animais; Aurora Quinase B/metabolismo; Teorema de Bayes; Sítios de Ligação; Proteínas Quinases Dependentes de AMP Cíclico/metabolismo; Bases de Dados Genéticas; Humanos; Internet; Aprendizado de Máquina; Camundongos; Fosfoproteínas/metabolismo; Fosforilação; Ligação Proteica; Proteínas Quinases/metabolismo; Proteínas Proto-Oncogênicas c-akt/metabolismo; Saccharomyces cerevisiae/genética; Saccharomyces cerevisiae/metabolismo; Sensibilidade e Especificidade; Transdução de Sinais

Palavras-chave

Bayesian networks; Kinases; Machine learning; Nuclear localisation; Phosphorylation

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Fosfoproteínas / Proteínas Quinases / Modelos Estatísticos / Proteínas Quinases Dependentes de AMP Cíclico / Proteínas Proto-Oncogênicas c-akt / Aurora Quinase B Tipo de estudo: Diagnostic_studies / Prognostic_studies / Risk_factors_studies Limite: Animals / Humans Idioma: En Ano de publicação: 2016 Tipo de documento: Article

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