A scalable assembly-free variable selection algorithm for biomarker discovery from metagenomes.

Gkanogiannis, Anestis; Gazut, Stéphane; Salanoubat, Marcel; Kanj, Sawsan; Brüls, Thomas

Gkanogiannis, Anestis; Gazut, Stéphane; Salanoubat, Marcel; Kanj, Sawsan; Brüls, Thomas.

Afiliação

Gkanogiannis A; Commissariat à l'Energie Atomique et aux Energies Alternatives, Direction de la Recherche Fondamentale, Institut de Génomique, Genoscope, Evry, Essonne, 91057, France.
Gazut S; UMR 8030 - Génomique Métabolique, Centre National de la Recherche Scientifique, Evry, Essonne, 91057, France.
Salanoubat M; Université d'Evry-Val-d'Essonne & Université Paris-Saclay, Evry, Essonne, 91000, France.
Kanj S; Commissariat à l'Energie Atomique et aux Energies Alternatives, Direction de la Recherche Technologique, CEA-Tech, LIST, Laboratoire d'Analyse de Données et Intelligence des Systèmes, 91191, Gif-sur-Yvette, France.
Brüls T; Commissariat à l'Energie Atomique et aux Energies Alternatives, Direction de la Recherche Fondamentale, Institut de Génomique, Genoscope, Evry, Essonne, 91057, France.

BMC Bioinformatics ; 17(1): 311, 2016 Aug 19.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-27542753

Assuntos

Algoritmos; Biomarcadores/química; Metagenoma; Metagenômica; Microbiota/genética; Conjuntos de Dados como Assunto; Humanos

Palavras-chave

Binning; Environmental genomics; Metagenomics; Microbiome; Sequence clustering; Unsupervised learning

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Algoritmos / Biomarcadores / Metagenoma / Metagenômica / Microbiota Tipo de estudo: Prognostic_studies Limite: Humans Idioma: En Ano de publicação: 2016 Tipo de documento: Article

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