Clonality Inference from Single Tumor Samples Using Low-Coverage Sequence Data.

Donmez, Nilgun; Malikic, Salem; Wyatt, Alexander W; Gleave, Martin E; Collins, Colin C; Sahinalp, S Cenk

Donmez, Nilgun; Malikic, Salem; Wyatt, Alexander W; Gleave, Martin E; Collins, Colin C; Sahinalp, S Cenk.

Afiliação

Donmez N; 1 School of Computing Science, Simon Fraser University , Burnaby, Canada .
Malikic S; 2 Vancouver Prostate Centre , Vancouver, Canada .
Wyatt AW; 1 School of Computing Science, Simon Fraser University , Burnaby, Canada .
Gleave ME; 2 Vancouver Prostate Centre , Vancouver, Canada .
Collins CC; 2 Vancouver Prostate Centre , Vancouver, Canada .
Sahinalp SC; 3 Department of Urologic Sciences, University of British Columbia , Vancouver, Canada .

J Comput Biol ; 24(6): 515-523, 2017 Jun.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-28056180

Assuntos

Algoritmos; Evolução Clonal; Biologia Computacional/métodos; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala/métodos; Neoplasias/genética; Análise de Célula Única/métodos; Variações do Número de Cópias de DNA; Frequência do Gene; Humanos; Modelos Genéticos; Reconhecimento Automatizado de Padrão/métodos; Software

Palavras-chave

DNA sequencing; cancer progression; intra-tumor heterogeneity

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Algoritmos / Biologia Computacional / Análise de Célula Única / Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala / Evolução Clonal / Neoplasias Limite: Humans Idioma: En Ano de publicação: 2017 Tipo de documento: Article

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