Distinguishing potential bacteria-tumor associations from contamination in a secondary data analysis of public cancer genome sequence data.

Robinson, Kelly M; Crabtree, Jonathan; Mattick, John S A; Anderson, Kathleen E; Dunning Hotopp, Julie C

Robinson, Kelly M; Crabtree, Jonathan; Mattick, John S A; Anderson, Kathleen E; Dunning Hotopp, Julie C.

Afiliação

Robinson KM; Institute for Genome Sciences, University of Maryland School of Medicine, Baltimore, MD, USA.
Crabtree J; Institute for Genome Sciences, University of Maryland School of Medicine, Baltimore, MD, USA.
Mattick JS; Institute for Genome Sciences, University of Maryland School of Medicine, Baltimore, MD, USA.
Anderson KE; Institute for Genome Sciences, University of Maryland School of Medicine, Baltimore, MD, USA.
Dunning Hotopp JC; Institute for Genome Sciences, University of Maryland School of Medicine, Baltimore, MD, USA. jdhotopp@som.umaryland.edu.

Microbiome ; 5(1): 9, 2017 Jan 25.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-28118849

Assuntos

Carcinoma/genética; Carcinoma/microbiologia; Bases de Dados Genéticas; Genoma Bacteriano; Genoma Humano; Leucemia Mieloide Aguda/microbiologia; Microbiota; Acinetobacter/genética; Bactérias/genética; Bactérias/isolamento & purificação; Sequência de Bases; Carcinoma/classificação; Carcinoma Epitelial do Ovário; Mapeamento Cromossômico; Cistadenocarcinoma Seroso/genética; Cistadenocarcinoma Seroso/microbiologia; Glioblastoma/genética; Glioblastoma/microbiologia; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala; Humanos; Leucemia Mieloide Aguda/genética; Mycobacterium tuberculosis/genética; Neoplasias Epiteliais e Glandulares/genética; Neoplasias Epiteliais e Glandulares/microbiologia; Neoplasias Ovarianas/genética; Neoplasias Ovarianas/microbiologia; Pseudomonas/genética

Palavras-chave

Acinetobacter; Acute myeloid leukemia; Batch effects; Cancer; Cancer-associated bacteria; Genome sequencing; Microbiome; Pseudomonas; Stomach adenocarcinoma

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Carcinoma / Leucemia Mieloide Aguda / Genoma Humano / Genoma Bacteriano / Bases de Dados Genéticas / Microbiota Tipo de estudo: Risk_factors_studies Limite: Humans Idioma: En Ano de publicação: 2017 Tipo de documento: Article

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