Added Value of Next-Generation Sequencing for Multilocus Sequence Typing Analysis of a Pneumocystis jirovecii Pneumonia Outbreak1.

Charpentier, Elena; Garnaud, Cécile; Wintenberger, Claire; Bailly, Sébastien; Murat, Jean-Benjamin; Rendu, John; Pavese, Patricia; Drouet, Thibault; Augier, Caroline; Malvezzi, Paolo; Thiébaut-Bertrand, Anne; Mallaret, Marie-Reine; Epaulard, Olivier; Cornet, Muriel; Larrat, Sylvie; Maubon, Danièle

Charpentier, Elena; Garnaud, Cécile; Wintenberger, Claire; Bailly, Sébastien; Murat, Jean-Benjamin; Rendu, John; Pavese, Patricia; Drouet, Thibault; Augier, Caroline; Malvezzi, Paolo; Thiébaut-Bertrand, Anne; Mallaret, Marie-Reine; Epaulard, Olivier; Cornet, Muriel; Larrat, Sylvie; Maubon, Danièle.

Emerg Infect Dis ; 23(8): 1237-1245, 2017 08.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-28726611

Assuntos

Tipagem de Sequências Multilocus; Pneumocystis carinii/classificação; Pneumocystis carinii/genética; Pneumonia por Pneumocystis/epidemiologia; Pneumonia por Pneumocystis/microbiologia; Adolescente; Adulto; Idoso; Estudos de Casos e Controles; Criança; Pré-Escolar; Biologia Computacional/métodos; Surtos de Doenças; Feminino; Genótipo; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala; Humanos; Lactente; Masculino; Pessoa de Meia-Idade; Filogenia; Pneumonia por Pneumocystis/transmissão; Polimorfismo Genético; Sensibilidade e Especificidade; Adulto Jovem

Palavras-chave

MLST; NGS; Pneumocystis jirovecii; disease outbreaks; fungi; high-throughput nucleotide sequencing; multilocus sequence typing; next-generation sequencing; pneumocystosis; pneumonia; respiratory infections; transplants

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Pneumonia por Pneumocystis / Pneumocystis carinii / Tipagem de Sequências Multilocus Tipo de estudo: Diagnostic_studies / Observational_studies / Risk_factors_studies Limite: Adolescent / Adult / Aged / Child / Child, preschool / Female / Humans / Infant / Male / Middle aged Idioma: En Ano de publicação: 2017 Tipo de documento: Article

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