Customizable de novo design strategies for DOCK: Application to HIVgp41 and other therapeutic targets.

Allen, William J; Fochtman, Brian C; Balius, Trent E; Rizzo, Robert C

Allen, William J; Fochtman, Brian C; Balius, Trent E; Rizzo, Robert C.

Afiliação

Allen WJ; Department of Applied Mathematics and Statistics, Stony Brook University, Stony Brook, New York, 11794.
Fochtman BC; Department of Biochemistry and Cell Biology, Stony Brook University, Stony Brook, New York, 11794.
Balius TE; Department of Pharmaceutical Chemistry, University of California, San Francisco, San Francisco, California, 94158.
Rizzo RC; Department of Applied Mathematics and Statistics, Stony Brook University, Stony Brook, New York, 11794.

J Comput Chem ; 38(30): 2641-2663, 2017 11 15.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-28940386

Assuntos

Proteína gp41 do Envelope de HIV/química; Simulação de Acoplamento Molecular/métodos; Bases de Dados de Compostos Químicos; Desenho de Fármacos; Ligantes; Ácido N-Acetilneuramínico/análogos & derivados; Ácido N-Acetilneuramínico/química; Ligação Proteica; Conformação Proteica

Palavras-chave

DOCK; ZINC; chemical space; de novo design; drug discovery; footprint similarity; fragment libraries; scoring functions; structure-based design

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Proteína gp41 do Envelope de HIV / Simulação de Acoplamento Molecular Tipo de estudo: Prognostic_studies Idioma: En Ano de publicação: 2017 Tipo de documento: Article

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