Systematic Characterization of Stress-Induced RNA Granulation.

Namkoong, Sim; Ho, Allison; Woo, Yu Mi; Kwak, Hojoong; Lee, Jun Hee

Namkoong, Sim; Ho, Allison; Woo, Yu Mi; Kwak, Hojoong; Lee, Jun Hee.

Afiliação

Namkoong S; Department of Molecular and Integrative Physiology, University of Michigan, Ann Arbor, MI 48109, USA.
Ho A; Department of Molecular and Integrative Physiology, University of Michigan, Ann Arbor, MI 48109, USA.
Woo YM; Department of Molecular Biology and Genetics, Cornell University, Ithaca, NY 14853, USA.
Kwak H; Department of Molecular Biology and Genetics, Cornell University, Ithaca, NY 14853, USA. Electronic address: hk572@cornell.edu.
Lee JH; Department of Molecular and Integrative Physiology, University of Michigan, Ann Arbor, MI 48109, USA. Electronic address: leeju@umich.edu.

Mol Cell ; 70(1): 175-187.e8, 2018 04 05.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-29576526

Assuntos

Grânulos Citoplasmáticos/metabolismo; Estresse do Retículo Endoplasmático; Resposta ao Choque Térmico; RNA Mensageiro/metabolismo; Ribonucleoproteínas/metabolismo; Transcriptoma; Elementos Ricos em Adenilato e Uridilato; Animais; Arsenitos/toxicidade; Sítios de Ligação; Grânulos Citoplasmáticos/genética; Estresse do Retículo Endoplasmático/efeitos dos fármacos; Células HCT116; Células HEK293; Humanos; Camundongos; Células NIH 3T3; Ligação Proteica; Proto-Oncogenes; RNA Longo não Codificante/genética; RNA Longo não Codificante/metabolismo; RNA Mensageiro/genética; Proteínas de Ligação a RNA/genética; Proteínas de Ligação a RNA/metabolismo; Ribonucleoproteínas/genética; Solubilidade; Tapsigargina/toxicidade; Fatores de Transcrição/genética; Fatores de Transcrição/metabolismo; Transcriptoma/efeitos dos fármacos

Palavras-chave

AU-rich elements; ER stress; RNA-seq; RNP granule; arsenite toxicity; heat shock; stress granule; transcriptome

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Ribonucleoproteínas / RNA Mensageiro / Resposta ao Choque Térmico / Grânulos Citoplasmáticos / Transcriptoma / Estresse do Retículo Endoplasmático Tipo de estudo: Prognostic_studies Limite: Animals / Humans Idioma: En Ano de publicação: 2018 Tipo de documento: Article

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