Systematic prediction of genes functionally linked to CRISPR-Cas systems by gene neighborhood analysis.

Shmakov, Sergey A; Makarova, Kira S; Wolf, Yuri I; Severinov, Konstantin V; Koonin, Eugene V

Shmakov, Sergey A; Makarova, Kira S; Wolf, Yuri I; Severinov, Konstantin V; Koonin, Eugene V.

Afiliação

Shmakov SA; Center for Data-Intensive Biomedicine and Biotechnology, Skolkovo Institute of Science and Technology, 143025 Skolkovo, Russia.
Makarova KS; National Center for Biotechnology Information, National Library of Medicine, Bethesda, MD 20894.
Wolf YI; National Center for Biotechnology Information, National Library of Medicine, Bethesda, MD 20894.
Severinov KV; National Center for Biotechnology Information, National Library of Medicine, Bethesda, MD 20894.
Koonin EV; Center for Data-Intensive Biomedicine and Biotechnology, Skolkovo Institute of Science and Technology, 143025 Skolkovo, Russia.

Proc Natl Acad Sci U S A ; 115(23): E5307-E5316, 2018 06 05.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-29784811

Assuntos

Sistemas CRISPR-Cas/genética; Repetições Palindrômicas Curtas Agrupadas e Regularmente Espaçadas/genética; Archaea/genética; Bactérias/genética; Sequência de Bases; Proteínas Associadas a CRISPR/genética; Simulação por Computador; Evolução Molecular; Genes Bacterianos; Testes Genéticos; Genoma Arqueal; Genoma Bacteriano; Filogenia

Palavras-chave

CRISPR-Cas; computational genomics; gene neighborhoods; membrane proteins; signaling

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Repetições Palindrômicas Curtas Agrupadas e Regularmente Espaçadas / Sistemas CRISPR-Cas Tipo de estudo: Prognostic_studies / Risk_factors_studies Idioma: En Ano de publicação: 2018 Tipo de documento: Article

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