All-atom simulations disentangle the functional dynamics underlying gene maturation in the intron lariat spliceosome.

Casalino, Lorenzo; Palermo, Giulia; Spinello, Angelo; Rothlisberger, Ursula; Magistrato, Alessandra

Casalino, Lorenzo; Palermo, Giulia; Spinello, Angelo; Rothlisberger, Ursula; Magistrato, Alessandra.

Afiliação

Casalino L; Molecular and Statistical Biophysics, International School for Advanced Studies (SISSA), 34136 Trieste, Italy.
Palermo G; Department of Bioengineering, University of California, Riverside, CA 92507.
Spinello A; Consiglio Nazionale delle Ricerche-Istituto Officina dei Materiali-Democritos National Simulation Center c/o International School for Advanced Studies (SISSA), 34136 Trieste, Italy.
Rothlisberger U; Laboratory of Computational Chemistry and Biochemistry, École Polytechnique Fédérale de Lausanne, CH-1015 Lausanne, Switzerland.
Magistrato A; Consiglio Nazionale delle Ricerche-Istituto Officina dei Materiali-Democritos National Simulation Center c/o International School for Advanced Studies (SISSA), 34136 Trieste, Italy; alessandra.magistrato@sissa.it.

Proc Natl Acad Sci U S A ; 115(26): 6584-6589, 2018 06 26.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-29891649

Assuntos

Simulação por Computador; Íntrons/genética; Modelos Genéticos; Conformação de Ácido Nucleico; Precursores de RNA/metabolismo; Splicing de RNA/fisiologia; Proteínas Repressoras/fisiologia; Ribonucleoproteína Nuclear Pequena U5/fisiologia; Proteínas de Schizosaccharomyces pombe/fisiologia; Spliceossomos/fisiologia; Magnésio/fisiologia; Modelos Moleculares; Simulação de Dinâmica Molecular; Movimento (Física); Análise de Componente Principal; Conformação Proteica; Precursores de RNA/genética; RNA Fúngico/genética; RNA Fúngico/metabolismo; RNA Nuclear Pequeno/genética; RNA Nuclear Pequeno/metabolismo; Proteínas Repressoras/química; Ribonucleoproteína Nuclear Pequena U5/química; Schizosaccharomyces/genética; Schizosaccharomyces/metabolismo; Proteínas de Schizosaccharomyces pombe/química; Eletricidade Estática

Palavras-chave

RNA; gene maturation; molecular dynamics; spliceosome; splicing

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Proteínas Repressoras / Simulação por Computador / Precursores de RNA / Íntrons / Splicing de RNA / Spliceossomos / Ribonucleoproteína Nuclear Pequena U5 / Proteínas de Schizosaccharomyces pombe / Modelos Genéticos / Conformação de Ácido Nucleico Tipo de estudo: Prognostic_studies Idioma: En Ano de publicação: 2018 Tipo de documento: Article

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