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Comparative mitogenomic analyses of Amazona parrots and Psittaciformes.
Lima, Nicholas Costa Barroso; Soares, André Elias Rodrigues; Almeida, Luiz Gonzaga de Paula; Costa, Igor Rodrigues da; Sato, Fernanda Midori; Schneider, Patricia; Aleixo, Alexandre; Schneider, Maria Paula; Santos, Fabrício R; Mello, Claudio V; Miyaki, Cristina; Vasconcelos, Ana Tereza R; Prosdocimi, Francisco.
Afiliação
  • Lima NCB; Laboratório de Genômica e Biodiversidade, Instituto de Bioquímica Médica Leopoldo de Meis, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, RJ, Brazil.
  • Soares AER; Laboratório de Bioinformática, Laboratório Nacional de Computação Científica, Petrópolis, RJ, Brazil.
  • Almeida LGP; Departamento de Bioquímica e Biologia Molecular, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, CE, Brazil.
  • Costa IRD; Laboratório de Bioinformática, Laboratório Nacional de Computação Científica, Petrópolis, RJ, Brazil.
  • Sato FM; Laboratório de Bioinformática, Laboratório Nacional de Computação Científica, Petrópolis, RJ, Brazil.
  • Schneider P; Laboratório de Genômica e Biodiversidade, Instituto de Bioquímica Médica Leopoldo de Meis, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, RJ, Brazil.
  • Aleixo A; Laboratório de Genética e Evolução Molecular de Aves, Departamento de Genética e Biologia Evolutiva, Instituto de Biociências, Universidade de São Paulo, SP, Brazil.
  • Schneider MP; Departamento de Genética, Centro de Ciências Biológicas, Universidade Federal do Pará, Belém, PA, Brazil.
  • Santos FR; Coordenação de Zoologia, Museu Paraense Emilio Goeldi, Belém, PA, Brazil.
  • Mello CV; Departamento de Genética, Centro de Ciências Biológicas, Universidade Federal do Pará, Belém, PA, Brazil.
  • Miyaki C; Departamento de Biologia Geral, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, MG, Brazil.
  • Vasconcelos ATR; Department of Behavioral Neuroscience, Oregon Health & Science University, Portland, OR, USA.
  • Prosdocimi F; Laboratório de Genética e Evolução Molecular de Aves, Departamento de Genética e Biologia Evolutiva, Instituto de Biociências, Universidade de São Paulo, SP, Brazil.
Genet Mol Biol ; 41(3): 593-604, 2018.
Article em En | MEDLINE | ID: mdl-30235395
ABSTRACT
Amazon parrots are long-lived birds with highly developed cognitive skills, including vocal learning. Several parrot mitogenomes have been sequenced, but important aspects of their organization and evolution are not fully understood or have limited experimental support. The main aim of the present study was to describe the mitogenome of the blue-fronted Amazon, Amazona aestiva, and compare it to other mitogenomes from the genus Amazona and the order Psittaciformes. We observed that mitogenomes are highly conserved among Amazon parrots, and a detailed analysis of their duplicated control regions revealed conserved blocks. Population level analyses indicated that the specimen analyzed here seems to be close to A. aestiva individuals from Bahia state. Evolutionary relationships of 41 Psittaciformes species and three outgroups were inferred by BEAST. All relationships were retrieved with high support.