A nearest-neighbors network model for sequence data reveals new insight into genotype distribution of a pathogen.

Catanese, Helen N; Brayton, Kelly A; Gebremedhin, Assefaw H

Catanese, Helen N; Brayton, Kelly A; Gebremedhin, Assefaw H.

Afiliação

Catanese HN; School of Electrical Engineering and Computer Science, Washington State University, Pullman, WA, USA.
Brayton KA; School of Electrical Engineering and Computer Science, Washington State University, Pullman, WA, USA.
Gebremedhin AH; Department of Veterinary Microbiology and Pathology, Washington State University, Pullman, WA, USA.

BMC Bioinformatics ; 19(1): 475, 2018 Dec 12.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-30541438

Assuntos

Sequência de Aminoácidos/genética; Proteínas/química; Análise por Conglomerados; Genótipo; Metanálise em Rede

Palavras-chave

Anaplasma marginale Msp1a; Centrality; Clustering; GroEL; Network analysis; Sequence similarity network

Texto completo

Imprimir

XML

PubMed Links

Buscar no Google

Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Proteínas / Sequência de Aminoácidos Idioma: En Ano de publicação: 2018 Tipo de documento: Article

Texto completo

Imprimir

XML

PubMed Links

Buscar no Google

Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Proteínas / Sequência de Aminoácidos Idioma: En Ano de publicação: 2018 Tipo de documento: Article