Accuracy of RNAseq based SNP discovery and genotyping in Populusnigra.

Rogier, Odile; Chateigner, Aurélien; Amanzougarene, Souhila; Lesage-Descauses, Marie-Claude; Balzergue, Sandrine; Brunaud, Véronique; Caius, José; Soubigou-Taconnat, Ludivine; Jorge, Véronique; Segura, Vincent

Rogier, Odile; Chateigner, Aurélien; Amanzougarene, Souhila; Lesage-Descauses, Marie-Claude; Balzergue, Sandrine; Brunaud, Véronique; Caius, José; Soubigou-Taconnat, Ludivine; Jorge, Véronique; Segura, Vincent.

Afiliação

Rogier O; BioForA, INRA, ONF, Orléans, 45075, France.
Chateigner A; BioForA, INRA, ONF, Orléans, 45075, France.
Amanzougarene S; BioForA, INRA, ONF, Orléans, 45075, France.
Lesage-Descauses MC; BioForA, INRA, ONF, Orléans, 45075, France.
Balzergue S; Institute of Plant Sciences Paris-Saclay (IPS2), CNRS, INRA, Université Paris-Sud, Université Paris-Saclay, Université d'Evry, Université Paris-Diderot, Sorbonne Paris-Cité, Orsay, 91405, France.
Brunaud V; IRHS, INRA, Agrocampus-Ouest, Université d'Angers, SFR 4207 QUASAV, Beaucouzé, 49071, France.
Caius J; Institute of Plant Sciences Paris-Saclay (IPS2), CNRS, INRA, Université Paris-Sud, Université Paris-Saclay, Université d'Evry, Université Paris-Diderot, Sorbonne Paris-Cité, Orsay, 91405, France.
Soubigou-Taconnat L; Institute of Plant Sciences Paris-Saclay (IPS2), CNRS, INRA, Université Paris-Sud, Université Paris-Saclay, Université d'Evry, Université Paris-Diderot, Sorbonne Paris-Cité, Orsay, 91405, France.
Jorge V; Institute of Plant Sciences Paris-Saclay (IPS2), CNRS, INRA, Université Paris-Sud, Université Paris-Saclay, Université d'Evry, Université Paris-Diderot, Sorbonne Paris-Cité, Orsay, 91405, France.
Segura V; BioForA, INRA, ONF, Orléans, 45075, France.

BMC Genomics ; 19(1): 909, 2018 Dec 12.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-30541448

Assuntos

Genes de Plantas; Polimorfismo de Nucleotídeo Único; Populus/genética; Regiões 3' não Traduzidas; Regiões 5' não Traduzidas; Mapeamento Cromossômico; Análise por Conglomerados; Éxons; Genótipo; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala; RNA de Plantas/química; RNA de Plantas/isolamento & purificação; RNA de Plantas/metabolismo; Análise de Sequência de RNA

Palavras-chave

Bioinformatics pipeline; Black poplar; DNA polymorphisms; Transcriptomics

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Genes de Plantas / Polimorfismo de Nucleotídeo Único / Populus Idioma: En Ano de publicação: 2018 Tipo de documento: Article

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