Characterization of HPV integration, viral gene expression and E6E7 alternative transcripts by RNA-Seq: A descriptive study in invasive cervical cancer.

Brant, Ayslan C; Menezes, Albert N; Felix, Shayany P; de Almeida, Liz M; Sammeth, Michael; Moreira, Miguel A M

Brant, Ayslan C; Menezes, Albert N; Felix, Shayany P; de Almeida, Liz M; Sammeth, Michael; Moreira, Miguel A M.

Afiliação

Brant AC; Genetics Program, Instituto Nacional de Câncer (INCA), Rio de Janeiro, Brazil; Post-Graduate Program in Genetics, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Brazil.
Menezes AN; Institute of Cancer and Genomic Sciences, College of Medical and Dental Sciences, University of Birmingham, UK.
Felix SP; Genetics Program, Instituto Nacional de Câncer (INCA), Rio de Janeiro, Brazil.
de Almeida LM; Department of Population Research, Instituto Nacional de Câncer (INCA), Rio de Janeiro, Brazil. Electronic address: lalmeida@inca.gov.br.
Sammeth M; Department of Bioinformatics, Transcriptomics and Functional Genomics, Federal University of Rio de Janeiro (UFRJ), Brazil. Electronic address: micha@sammeth.net.
Moreira MAM; Genetics Program, Instituto Nacional de Câncer (INCA), Rio de Janeiro, Brazil. Electronic address: miguelm@inca.gov.br.

Genomics ; 111(6): 1853-1861, 2019 12.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-30552977

Assuntos

Proteínas de Ligação a DNA; Regulação Neoplásica da Expressão Gênica; Regulação Viral da Expressão Gênica; Papillomavirus Humano 16; Papillomavirus Humano 18; Proteínas Oncogênicas Virais; Proteínas E7 de Papillomavirus; RNA-Seq; Proteínas Repressoras; Neoplasias do Colo do Útero; Integração Viral; Processamento Alternativo; Proteínas de Ligação a DNA/biossíntese; Proteínas de Ligação a DNA/genética; Feminino; Papillomavirus Humano 16/genética; Papillomavirus Humano 16/metabolismo; Papillomavirus Humano 18/genética; Papillomavirus Humano 18/metabolismo; Humanos; Proteínas Oncogênicas Virais/biossíntese; Proteínas Oncogênicas Virais/genética; Proteínas E7 de Papillomavirus/biossíntese; Proteínas E7 de Papillomavirus/genética; Proteínas Repressoras/biossíntese; Proteínas Repressoras/genética; Neoplasias do Colo do Útero/genética; Neoplasias do Colo do Útero/metabolismo; Neoplasias do Colo do Útero/patologia; Neoplasias do Colo do Útero/virologia

Palavras-chave

Alternative splicing; Cervical cancer; E6E7 alternative transcripts; HPV expression; HPV genome integration

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Proteínas Repressoras / Regulação Neoplásica da Expressão Gênica / Regulação Viral da Expressão Gênica / Neoplasias do Colo do Útero / Proteínas Oncogênicas Virais / Integração Viral / Proteínas de Ligação a DNA / Papillomavirus Humano 16 / Papillomavirus Humano 18 / Proteínas E7 de Papillomavirus Limite: Female / Humans Idioma: En Ano de publicação: 2019 Tipo de documento: Article

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