TPP riboswitch aptamer: Role of Mg<sup>2+</sup> ions, ligand unbinding, and allostery.

Padhi, Siladitya; Pradhan, Meenakshi; Bung, Navneet; Roy, Arijit; Bulusu, Gopalakrishnan

TPP riboswitch aptamer: Role of Mg²⁺ ions, ligand unbinding, and allostery.

Padhi, Siladitya; Pradhan, Meenakshi; Bung, Navneet; Roy, Arijit; Bulusu, Gopalakrishnan.

Afiliação

Padhi S; TCS Innovation Labs - Hyderabad (Life Sciences Division), Tata Consultancy Services Limited, Hyderabad, 500081, India.
Pradhan M; TCS Innovation Labs - Hyderabad (Life Sciences Division), Tata Consultancy Services Limited, Hyderabad, 500081, India.
Bung N; TCS Innovation Labs - Hyderabad (Life Sciences Division), Tata Consultancy Services Limited, Hyderabad, 500081, India.
Roy A; TCS Innovation Labs - Hyderabad (Life Sciences Division), Tata Consultancy Services Limited, Hyderabad, 500081, India.
Bulusu G; TCS Innovation Labs - Hyderabad (Life Sciences Division), Tata Consultancy Services Limited, Hyderabad, 500081, India. Electronic address: g.bulusu@tcs.com.

J Mol Graph Model ; 88: 282-291, 2019 05.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-30818079

Assuntos

Aptâmeros de Nucleotídeos/química; Aptâmeros de Peptídeos/química; Riboswitch; Tiamina Pirofosfato/química; Regulação Alostérica; Sítio Alostérico; Aptâmeros de Peptídeos/metabolismo; Sítios de Ligação; Íons/química; Ligantes; Simulação de Dinâmica Molecular; Conformação de Ácido Nucleico; Tiamina Pirofosfato/metabolismo

Palavras-chave

Cation-RNA interactions; Ligand unbinding; Molecular dynamics; Ribonucleic acid (RNA); Thiamine pyrophosphate riboswitch

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Tiamina Pirofosfato / Aptâmeros de Peptídeos / Aptâmeros de Nucleotídeos / Riboswitch Tipo de estudo: Prognostic_studies Idioma: En Ano de publicação: 2019 Tipo de documento: Article

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