De Novo Plant Transcriptome Assembly and Annotation Using Illumina RNA-Seq Reads.

Kerr, Stephanie C; Gaiti, Federico; Tanurdzic, Milos

Kerr, Stephanie C; Gaiti, Federico; Tanurdzic, Milos.

Afiliação

Kerr SC; School of Biological Sciences, The University of Queensland, St Lucia, QLD, Australia.
Gaiti F; New York Genome Center and Department of Medicine, Weill Cornell Medicine, New York, NY, USA.
Tanurdzic M; School of Biological Sciences, The University of Queensland, St Lucia, QLD, Australia. m.tanurdzic@uq.edu.au.

Methods Mol Biol ; 1933: 265-275, 2019.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-30945191

Assuntos

Arabidopsis/genética; Biologia Computacional/métodos; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala/métodos; RNA Longo não Codificante/genética; RNA de Plantas/genética; Análise de Sequência de RNA/métodos; Regulação da Expressão Gênica de Plantas; Transcriptoma

Palavras-chave

De novo transcriptome assembly; Long noncoding RNA; RNA-seq; Trinity

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Análise de Sequência de RNA / Arabidopsis / RNA de Plantas / Biologia Computacional / Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala / RNA Longo não Codificante Idioma: En Ano de publicação: 2019 Tipo de documento: Article

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