De novo Nanopore read quality improvement using deep learning.

LaPierre, Nathan; Egan, Rob; Wang, Wei; Wang, Zhong

LaPierre, Nathan; Egan, Rob; Wang, Wei; Wang, Zhong.

Afiliação

LaPierre N; Department of Computer Science, University of California, Los Angeles, Los Angeles, CA, 90095, USA.
Egan R; Department of Energy Joint Genome Institute, Walnut Creek, CA, 94598, USA.
Wang W; Department of Computer Science, University of California, Los Angeles, Los Angeles, CA, 90095, USA. weiwang@cs.ucla.edu.
Wang Z; Department of Energy Joint Genome Institute, Walnut Creek, CA, 94598, USA. zhongwang@lbl.gov.

BMC Bioinformatics ; 20(1): 552, 2019 Nov 06.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-31694525

Assuntos

Aprendizado Profundo/normas; Sequenciamento por Nanoporos/métodos; Bases de Dados Genéticas; Humanos; Metagenoma; Melhoria de Qualidade; Software

Palavras-chave

Deep learning; Long sequence reads; Oxford Nanopore; de novo assembly

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Aprendizado Profundo / Sequenciamento por Nanoporos Tipo de estudo: Prognostic_studies Limite: Humans Idioma: En Ano de publicação: 2019 Tipo de documento: Article

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