HTRgene: a computational method to perform the integrated analysis of multiple heterogeneous time-series data: case analysis of cold and heat stress response signaling genes in Arabidopsis.

Ahn, Hongryul; Jung, Inuk; Chae, Heejoon; Kang, Dongwon; Jung, Woosuk; Kim, Sun

Ahn, Hongryul; Jung, Inuk; Chae, Heejoon; Kang, Dongwon; Jung, Woosuk; Kim, Sun.

Afiliação

Ahn H; Department of Computer Science and Engineering, Seoul National University, Seoul, Korea.
Jung I; Department of Computer Science and Engineering, Kyungpook National University, Daegu, Korea.
Chae H; Division of Computer Science, Sookmyung Women's University, Seoul, Korea.
Kang D; Department of Computer Science and Engineering, Seoul National University, Seoul, Korea.
Jung W; Department of Crop Science, Konkuk University, Seoul, Korea. jungw@konkuk.ac.kr.
Kim S; Department of Computer Science and Engineering, Seoul National University, Seoul, Korea. sunkim.bioinfo@snu.ac.kr.

BMC Bioinformatics ; 20(Suppl 16): 588, 2019 Dec 02.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-31787073

Assuntos

Algoritmos; Arabidopsis/genética; Arabidopsis/fisiologia; Temperatura Baixa; Biologia Computacional/métodos; Genes de Plantas; Resposta ao Choque Térmico/genética; Transdução de Sinais/genética; Bases de Dados Genéticas; Perfilação da Expressão Gênica; Regulação da Expressão Gênica de Plantas; Redes Reguladoras de Genes; Fatores de Tempo; Fatores de Transcrição/metabolismo

Palavras-chave

Integration analysis; Multiple time-series gene expression data; Response order preserving DEG; Stress response

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Algoritmos / Transdução de Sinais / Genes de Plantas / Arabidopsis / Temperatura Baixa / Resposta ao Choque Térmico / Biologia Computacional Tipo de estudo: Prognostic_studies Idioma: En Ano de publicação: 2019 Tipo de documento: Article

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