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Real-time PCR for direct aptamer quantification on functionalized graphene surfaces.
Dos Santos, Viviane C F; Almeida, Nathalie B F; de Sousa, Thiago A S L; Araujo, Eduardo N D; de Andrade, Antero S R; Plentz, Flávio.
Afiliação
  • Dos Santos VCF; Departamento de Física, ICEx, Universidade Federal de Minas Gerais, Avenida Presidente Antônio Carlos 6627, Belo Horizonte, CEP 31270-901, Brazil. cfernandes.viviane@gmail.com.
  • Almeida NBF; Centro de Desenvolvimento da Tecnologia Nuclear (CDTN), Avenida Presidente Antônio Carlos 6627, Campus Pampulha da Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, CEP 31270-901, Brazil. cfernandes.viviane@gmail.com.
  • de Sousa TASL; Departamento de Física, ICEx, Universidade Federal de Minas Gerais, Avenida Presidente Antônio Carlos 6627, Belo Horizonte, CEP 31270-901, Brazil.
  • Araujo END; Centro de Desenvolvimento da Tecnologia Nuclear (CDTN), Avenida Presidente Antônio Carlos 6627, Campus Pampulha da Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, CEP 31270-901, Brazil.
  • de Andrade ASR; Departamento de Física, ICEx, Universidade Federal de Minas Gerais, Avenida Presidente Antônio Carlos 6627, Belo Horizonte, CEP 31270-901, Brazil.
  • Plentz F; Departamento de Física, CCE, Universidade Federal de Viçosa, Avenida Peter Henry Rolfs, s/n, Viçosa, CEP 36570-900, Brazil.
Sci Rep ; 9(1): 19311, 2019 12 17.
Article em En | MEDLINE | ID: mdl-31848419
In this study, we develop a real-time PCR strategy to directly detect and quantify DNA aptamers on functionalized graphene surfaces using a Staphylococcus aureus aptamer (SA20) as demonstration case. We show that real-time PCR allowed aptamer quantification in the range of 0.05 fg to 2.5 ng. Using this quantitative technique, it was possible to determine that graphene functionalization with amino modified SA20 (preceded by a graphene surface modification with thionine) was much more efficient than the process using SA20 with a pyrene modification. We also demonstrated that the functionalization methods investigated were selective to graphene as compared to bare silicon dioxide surfaces. The precise quantification of aptamers immobilized on graphene surface was performed for the first time by molecular biology techniques, introducing a novel methodology of wide application.
Assuntos

Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Técnicas Biossensoriais / Aptâmeros de Nucleotídeos / Reação em Cadeia da Polimerase em Tempo Real / Grafite Idioma: En Ano de publicação: 2019 Tipo de documento: Article

Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Técnicas Biossensoriais / Aptâmeros de Nucleotídeos / Reação em Cadeia da Polimerase em Tempo Real / Grafite Idioma: En Ano de publicação: 2019 Tipo de documento: Article