A novel graph theoretical approach for modeling microbiomes and inferring microbial ecological relationships.

Kim, Suyeon; Thapa, Ishwor; Zhang, Ling; Ali, Hesham

Kim, Suyeon; Thapa, Ishwor; Zhang, Ling; Ali, Hesham.

Afiliação

Kim S; School of Interdisciplinary Informatics, University of Nebraska at Omaha, Omaha, 68182, NE, USA.
Thapa I; School of Interdisciplinary Informatics, University of Nebraska at Omaha, Omaha, 68182, NE, USA.
Zhang L; School of Interdisciplinary Informatics, University of Nebraska at Omaha, Omaha, 68182, NE, USA.
Ali H; College of Information Science and Technology, University of Nebraska at Omaha, Omaha, 68182, NE, USA. hali@unomaha.edu.

BMC Genomics ; 20(Suppl 11): 945, 2019 Dec 20.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-31856723

Assuntos

Biologia Computacional/métodos; Interações Microbianas/fisiologia; Microbiota; Modelos Biológicos; Bactérias/classificação; Bactérias/genética; Bactérias/isolamento & purificação; Biomarcadores; Doença de Crohn/metabolismo; Doença de Crohn/microbiologia; Microbioma Gastrointestinal/genética; Humanos; Redes e Vias Metabólicas; Metagenoma; Fenótipo

Palavras-chave

Data integration; Graph theoretic models; Microbiomes; Split graphs

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Biologia Computacional / Interações Microbianas / Microbiota / Modelos Biológicos Limite: Humans Idioma: En Ano de publicação: 2019 Tipo de documento: Article

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