The corrected gene proximity map for analyzing the 3D genome organization using Hi-C data.

Ye, Cheng; Paccanaro, Alberto; Gerstein, Mark; Yan, Koon-Kiu

Ye, Cheng; Paccanaro, Alberto; Gerstein, Mark; Yan, Koon-Kiu.

Afiliação

Ye C; Department of Computer Science, Centre for Systems and Synthetic Biology, Royal Holloway, University of London, Egham, TW20 0EX, UK.
Paccanaro A; Department of Computer Science, Centre for Systems and Synthetic Biology, Royal Holloway, University of London, Egham, TW20 0EX, UK. alberto.paccanaro@rhul.ac.uk.
Gerstein M; School of Applied Mathematics, Fundação Getulio Vargas, Rio de Janeiro, Brazil. alberto.paccanaro@rhul.ac.uk.
Yan KK; Program in Computational Biology and Bioinformatics, Department of Molecular Biophysics and Biochemistry, Department of Computer Science, Department of Statistics and Data Science, Yale University, New Haven, CT, 06520, USA.

BMC Bioinformatics ; 21(1): 222, 2020 May 29.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-32471347

Assuntos

Cromossomos Humanos; Regulação da Expressão Gênica; Genoma Humano; Linhagem Celular; Genômica/métodos; Humanos; Redes e Vias Metabólicas/genética

Palavras-chave

3D genome; Hi-C data analysis; Network modularity; Network theory

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Genoma Humano / Regulação da Expressão Gênica / Cromossomos Humanos Limite: Humans Idioma: En Ano de publicação: 2020 Tipo de documento: Article

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