Automated Removal of Non-homologous Sequence Stretches with PREQUAL.

Irisarri, Iker; Burki, Fabien; Whelan, Simon

Irisarri, Iker; Burki, Fabien; Whelan, Simon.

Afiliação

Irisarri I; Department of Organismal Biology (Program in Systematic Biology), Uppsala University, Uppsala, Sweden. irisarri.iker@gmail.com.
Burki F; Department of Biodiversity and Evolutionary Biology, Museo Nacional de Ciencias Naturales, Madrid, Spain. irisarri.iker@gmail.com.
Whelan S; Department of Applied Bioinformatics, Institute for Microbiology and Genetics, University of Göttingen, Göttingen, Germany. irisarri.iker@gmail.com.

Methods Mol Biol ; 2231: 147-162, 2021.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-33289892

Assuntos

Biologia Computacional/métodos; Genômica/métodos; Cadeias de Markov; Análise de Sequência de DNA/métodos; Software; Algoritmos; Modelos Estatísticos; Filogenia; Reprodutibilidade dos Testes; Sensibilidade e Especificidade; Homologia de Sequência

Palavras-chave

Filtering; Genomics; HMM; Homology; Phylogenomics; Sequence analysis

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Software / Cadeias de Markov / Análise de Sequência de DNA / Biologia Computacional / Genômica Tipo de estudo: Diagnostic_studies / Health_economic_evaluation / Prognostic_studies / Risk_factors_studies Idioma: En Ano de publicação: 2021 Tipo de documento: Article

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