Assessing Uncertainty in the Rooting of the SARS-CoV-2 Phylogeny.

Pipes, Lenore; Wang, Hongru; Huelsenbeck, John P; Nielsen, Rasmus

Pipes, Lenore; Wang, Hongru; Huelsenbeck, John P; Nielsen, Rasmus.

Afiliação

Pipes L; Department of Integrative Biology, University of California, Berkeley, Berkeley, CA, USA.
Wang H; Department of Integrative Biology, University of California, Berkeley, Berkeley, CA, USA.
Huelsenbeck JP; Department of Integrative Biology, University of California, Berkeley, Berkeley, CA, USA.
Nielsen R; Department of Integrative Biology, University of California, Berkeley, Berkeley, CA, USA.

Mol Biol Evol ; 38(4): 1537-1543, 2021 04 13.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-33295605

Assuntos

COVID-19/virologia; Genoma Viral; Mutação; Filogenia; SARS-CoV-2/genética; Algoritmos; Animais; Teorema de Bayes; Evolução Molecular; Humanos; Funções Verossimilhança; Cadeias de Markov; Modelos Genéticos; Modelos Estatísticos; Método de Monte Carlo; Mutação de Sentido Incorreto; RNA Viral/genética; Incerteza

Palavras-chave

SARS-CoV-2 phylogeny; molecular clock rooting; outgroup rooting

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Filogenia / Genoma Viral / SARS-CoV-2 / COVID-19 / Mutação Tipo de estudo: Health_economic_evaluation / Prognostic_studies / Risk_factors_studies Limite: Animals / Humans Idioma: En Ano de publicação: 2021 Tipo de documento: Article

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