Automated detection of frog calls and choruses by pulse repetition rate.

RESUMEN

Los anuros (ranas y sapos) se encuentran dentro de los grupos taxonómicos más amenazados a nivel mundial. La conservación exitosa de los anuros dependerá de información mejorada sobre el estado y los cambios en las poblaciones locales, particularmente para las especies raras y amenazadas. Los sensores automatizados, como las grabadoras acústicas, tienen el potencial para proporcionar dicha información al incrementar masivamente la escala espacial y temporal de los esfuerzos de muestreo poblacional. El análisis de dicha información requerirá herramientas robustas y eficientes que puedan identificar automáticamente la presencia de una especie en las grabaciones de audio. Como las aves y los murciélagos, muchas especies de anuros producen vocalizaciones distintivas que pueden ser capturadas por las grabadoras acústicas autónomas y también son excelentes candidatas para el reconocimiento automatizado. Sin embargo, a diferencia de las aves y los murciélagos, todavía no se cuenta con una disponibilidad extensa de herramientas para el reconocimiento acústico automatizado de los anuros. Un método efectivo para el reconocimiento automatizado del canto de los anuros debe ser firme ante los retos de los datos reales de campo y no debería requerir conjuntos extensos de datos etiquetados. Diseñamos una herramienta de identificación de las vocalizaciones: la herramienta de identificación bioacústica basada en el intervalo de repetición (RIBBIT), el cual clasifica las vocalizaciones de los anuros en las grabaciones de audio con base en su estructura periódica. Aplicamos la RIBBIT a las grabaciones de campo para estudiar a dos especies: la rana coral boreal (Pseudacris maculata) de los pastizales templados de América del Norte y la rana arlequín variable (Atelopus varius), críticamente en peligro de extinción, de las selvas tropicales de América Central. Mostramos que RIBBIT puede identificar correctamente a las ranas corales boreales, incluso cuando vocalizan en coros con mucha superposición, y puede identificar las vocalizaciones de la rana arlequín variable en un sitio de campo en donde rara vez se le ha visto durante censos visuales. Mediante relativamente unos cuantos parámetros simples, RIBBIT puede detectar cualquier vocalización con una estructura periódica, incluyendo aquellas de muchos anuros, insectos, aves y mamíferos. Proporcionamos implementaciones de fuente abierta de RIBBIT en Python y en R para fomentar su uso para otros taxones y comunidades.