Efficient Detection of Transposable Element Insertion Polymorphisms Between Genomes Using Short-Read Sequencing Data.

Baduel, Pierre; Quadrana, Leandro; Colot, Vincent

Baduel, Pierre; Quadrana, Leandro; Colot, Vincent.

Afiliação

Baduel P; Institut de Biologie de l'Ecole Normale Supérieure (IBENS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Ecole Normale Supérieure, PSL Research University, Paris, France.
Quadrana L; Institut de Biologie de l'Ecole Normale Supérieure (IBENS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Ecole Normale Supérieure, PSL Research University, Paris, France. leandro.quadrana@ens.psl.eu.
Colot V; Institut de Biologie de l'Ecole Normale Supérieure (IBENS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Ecole Normale Supérieure, PSL Research University, Paris, France. vincent.colot@ens.psl.eu.

Methods Mol Biol ; 2250: 157-169, 2021.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-33900602

Assuntos

Arabidopsis/genética; Biologia Computacional/métodos; Elementos de DNA Transponíveis; Polimorfismo Genético; Algoritmos; Genoma de Planta; Análise de Sequência de DNA

Palavras-chave

TE insertion polymorphism; Transposable element

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Polimorfismo Genético / Elementos de DNA Transponíveis / Arabidopsis / Biologia Computacional Tipo de estudo: Diagnostic_studies Idioma: En Ano de publicação: 2021 Tipo de documento: Article

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