Are dropout imputation methods for scRNA-seq effective for scATAC-seq data?

Liu, Yue; Zhang, Junfeng; Wang, Shulin; Zeng, Xiangxiang; Zhang, Wei

Liu, Yue; Zhang, Junfeng; Wang, Shulin; Zeng, Xiangxiang; Zhang, Wei.

Afiliação

Liu Y; College of Computer Science and Electronic Engineering, Hunan University, Changsha, Hunan 410082, China.
Zhang J; College of Computer Science and Electronic Engineering, Hunan University, Changsha, Hunan 410082, China.
Wang S; College of Computer Science and Electronic Engineering, Hunan University, Changsha, Hunan 410082, China.
Zeng X; College of Computer Science and Electronic Engineering, Hunan University, Changsha, Hunan 410082, China.
Zhang W; College of Computer Engineering & Applied Mathematics, Changsha University, Changsha, Hunan 410003, China.

Brief Bioinform ; 23(1)2022 01 17.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-34718405

Assuntos

Análise de Célula Única; Software; Análise por Conglomerados; Análise de Sequência de RNA; Sequenciamento do Exoma

Palavras-chave

dropout events; imputation method; single-cell ATAC-seq; single-cell RNA-seq

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Software / Análise de Célula Única Idioma: En Ano de publicação: 2022 Tipo de documento: Article

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