A parameter-free deep embedded clustering method for single-cell RNA-seq data.

Zeng, Yuansong; Wei, Zhuoyi; Zhong, Fengqi; Pan, Zixiang; Lu, Yutong; Yang, Yuedong

Zeng, Yuansong; Wei, Zhuoyi; Zhong, Fengqi; Pan, Zixiang; Lu, Yutong; Yang, Yuedong.

Afiliação

Zeng Y; School of Computer Science and Engineering, Sun Yat-sen University, Guangzhou 510000, China.
Wei Z; School of Computer Science and Engineering, Sun Yat-sen University, Guangzhou 510000, China.
Zhong F; School of Computer Science and Engineering, Sun Yat-sen University, Guangzhou 510000, China.
Pan Z; School of Computer Science and Engineering, Sun Yat-sen University, Guangzhou 510000, China.
Lu Y; School of Computer Science and Engineering, Sun Yat-sen University, Guangzhou 510000, China.
Yang Y; School of Computer Science and Engineering, Sun Yat-sen University, Guangzhou 510000, China.

Brief Bioinform ; 23(5)2022 09 20.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-35524494

Assuntos

RNA; Análise de Célula Única; Algoritmos; Análise por Conglomerados; Perfilação da Expressão Gênica/métodos; RNA/genética; RNA-Seq; Análise de Sequência de RNA/métodos; Análise de Célula Única/métodos

Palavras-chave

deep embedded clustering; dip-test; estimating the number of cell clusters; single-cell RNA sequencing; single-cell clustering

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: RNA / Análise de Célula Única Idioma: En Ano de publicação: 2022 Tipo de documento: Article

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