Detalhe da pesquisa
1.
Anti-CRISPR prediction using deep learning reveals an inhibitor of Cas13b nucleases.
Mol Cell
; 82(14): 2714-2726.e4, 2022 07 21.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35649413
2.
Interrogating two extensively self-targeting Type I CRISPR-Cas systems in Xanthomonas albilineans reveals distinct anti-CRISPR proteins that block DNA degradation.
Nucleic Acids Res
; 52(2): 769-783, 2024 Jan 25.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38015466
3.
RiboReport - benchmarking tools for ribosome profiling-based identification of open reading frames in bacteria.
Brief Bioinform
; 23(2)2022 03 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35037022
4.
Gene Expression-Based Cancer Classification for Handling the Class Imbalance Problem and Curse of Dimensionality.
Int J Mol Sci
; 25(4)2024 Feb 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38396779
5.
CRISPRtracrRNA: robust approach for CRISPR tracrRNA detection.
Bioinformatics
; 38(Suppl_2): ii42-ii48, 2022 09 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36124799
6.
CRISPRidentify: identification of CRISPR arrays using machine learning approach.
Nucleic Acids Res
; 49(4): e20, 2021 02 26.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33290505
7.
CRISPRloci: comprehensive and accurate annotation of CRISPR-Cas systems.
Nucleic Acids Res
; 49(W1): W125-W130, 2021 07 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34133710
8.
Current Bioinformatics Tools to Optimize CRISPR/Cas9 Experiments to Reduce Off-Target Effects.
Int J Mol Sci
; 24(7)2023 Mar 27.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37047235
9.
Casboundary: automated definition of integral Cas cassettes.
Bioinformatics
; 37(10): 1352-1359, 2021 06 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33226067
10.
Adaptation induced by self-targeting in a type I-B CRISPR-Cas system.
J Biol Chem
; 295(39): 13502-13515, 2020 09 25.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32723866
11.
CRISPR-Cas bioinformatics.
Methods
; 172: 3-11, 2020 02 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31326596
12.
Freiburg RNA tools: a central online resource for RNA-focused research and teaching.
Nucleic Acids Res
; 46(W1): W25-W29, 2018 07 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29788132
13.
Cross-cleavage activity of Cas6b in crRNA processing of two different CRISPR-Cas systems in Methanosarcina mazei Gö1.
RNA Biol
; 16(4): 492-503, 2019 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30153081
14.
Comprehensive search for accessory proteins encoded with archaeal and bacterial type III CRISPR-cas gene cassettes reveals 39 new cas gene families.
RNA Biol
; 16(4): 530-542, 2019 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29911924
15.
CRISPR-Cas systems in multicellular cyanobacteria.
RNA Biol
; 16(4): 518-529, 2019 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29995583
16.
The nuts and bolts of the Haloferax CRISPR-Cas system I-B.
RNA Biol
; 16(4): 469-480, 2019 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29649958
17.
Structural constraints and enzymatic promiscuity in the Cas6-dependent generation of crRNAs.
Nucleic Acids Res
; 45(2): 915-925, 2017 01 25.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27599840
18.
Plasticity of archaeal C/D box sRNA biogenesis.
Mol Microbiol
; 103(1): 151-164, 2017 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27743417
19.
Methanosarcina Spherical Virus, a Novel Archaeal Lytic Virus Targeting Methanosarcina Strains.
J Virol
; 91(22)2017 11 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28878086
20.
Characterizing leader sequences of CRISPR loci.
Bioinformatics
; 32(17): i576-i585, 2016 09 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27587677