Detalhe da pesquisa
1.
Reproducible acquisition, management and meta-analysis of nucleotide sequence (meta)data using q2-fondue.
Bioinformatics
; 38(22): 5081-5091, 2022 11 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36130056
2.
Multi-omics data integration reveals metabolome as the top predictor of the cervicovaginal microenvironment.
PLoS Comput Biol
; 18(2): e1009876, 2022 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35196323
3.
A communal catalogue reveals Earth's multiscale microbial diversity.
Nature
; 551(7681): 457-463, 2017 11 23.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29088705
4.
Learning representations of microbe-metabolite interactions.
Nat Methods
; 16(12): 1306-1314, 2019 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31686038
5.
RESCRIPt: Reproducible sequence taxonomy reference database management.
PLoS Comput Biol
; 17(11): e1009581, 2021 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34748542
6.
Experiences and lessons learned from two virtual, hands-on microbiome bioinformatics workshops.
PLoS Comput Biol
; 17(6): e1009056, 2021 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34166363
7.
Infant behavioral state and stool microbiome in infants receiving Lactocaseibacillus rhamnosus GG in formula: randomized controlled trial.
BMC Pediatr
; 22(1): 580, 2022 10 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36207675
8.
Loss of HDAC6 alters gut microbiota and worsens obesity.
FASEB J
; 33(1): 1098-1109, 2019 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30102568
9.
Reply to: Examining microbe-metabolite correlations by linear methods.
Nat Methods
; 18(1): 40-41, 2021 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33398188
10.
Fecal microbiota and bile acid interactions with systemic and adipose tissue metabolism in diet-induced weight loss of obese postmenopausal women.
J Transl Med
; 16(1): 244, 2018 09 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30176893
11.
Microbial biogeography of wine grapes is conditioned by cultivar, vintage, and climate.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 111(1): E139-48, 2014 Jan 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24277822
12.
Quality-filtering vastly improves diversity estimates from Illumina amplicon sequencing.
Nat Methods
; 10(1): 57-9, 2013 Jan.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23202435
13.
Human milk glycomics and gut microbial genomics in infant feces show a correlation between human milk oligosaccharides and gut microbiota: a proof-of-concept study.
J Proteome Res
; 14(1): 491-502, 2015 Jan 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25300177
14.
Microbial biogeography of the transnational fermented milk matsoni.
Food Microbiol
; 50: 12-9, 2015 Sep.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25998810
15.
Indigenous bacteria and fungi drive traditional kimoto sake fermentations.
Appl Environ Microbiol
; 80(17): 5522-9, 2014 Sep.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24973064
16.
Prebiotic oligosaccharides in premature infants.
J Pediatr Gastroenterol Nutr
; 58(3): 352-60, 2014 Mar.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24135979
17.
Surface microbes in the neonatal intensive care unit: changes with routine cleaning and over time.
J Clin Microbiol
; 51(8): 2617-24, 2013 Aug.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23740726
18.
Improved selection of internal transcribed spacer-specific primers enables quantitative, ultra-high-throughput profiling of fungal communities.
Appl Environ Microbiol
; 79(8): 2519-26, 2013 Apr.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23377949
19.
Facility-specific "house" microbiome drives microbial landscapes of artisan cheesemaking plants.
Appl Environ Microbiol
; 79(17): 5214-23, 2013 Sep.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23793641
20.
A comparison of two probiotic strains of bifidobacteria in premature infants.
J Pediatr
; 163(6): 1585-1591.e9, 2013 Dec.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23993139