Detalhe da pesquisa
1.
COATi: statistical pairwise alignment of protein-coding sequences.
Mol Biol Evol
; 2024 Jun 13.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38869090
2.
A Probabilistic Model for Indel Evolution: Differentiating Insertions from Deletions.
Mol Biol Evol
; 38(12): 5769-5781, 2021 12 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34469521
3.
The first steps toward a global pandemic: Reconstructing the demographic history of parasite host switches in its native range.
Mol Ecol
; 31(5): 1358-1374, 2022 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34882860
4.
Mitogenomic phylogeny of Callithrix with special focus on human transferred taxa.
BMC Genomics
; 22(1): 239, 2021 Apr 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33823806
5.
A phylogenomic approach reveals a low somatic mutation rate in a long-lived plant.
Proc Biol Sci
; 287(1922): 20192364, 2020 03 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32156194
6.
Experimental evolution reveals an effective avenue to release catabolite repression via mutations in XylR.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 114(28): 7349-7354, 2017 07 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28655843
7.
accuMUlate: a mutation caller designed for mutation accumulation experiments.
Bioinformatics
; 34(15): 2659-2660, 2018 08 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29566129
8.
SpartaABC: a web server to simulate sequences with indel parameters inferred using an approximate Bayesian computation algorithm.
Nucleic Acids Res
; 45(W1): W453-W457, 2017 07 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28460062
9.
Estimating error models for whole genome sequencing using mixtures of Dirichlet-multinomial distributions.
Bioinformatics
; 33(15): 2322-2329, 2017 Aug 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28334373
10.
The role of gene flow in rapid and repeated evolution of cave-related traits in Mexican tetra, Astyanax mexicanus.
Mol Ecol
; 27(22): 4397-4416, 2018 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30252986
11.
The importance of selection in the evolution of blindness in cavefish.
BMC Evol Biol
; 17(1): 45, 2017 02 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28173751
12.
DeNovoGear: de novo indel and point mutation discovery and phasing.
Nat Methods
; 10(10): 985-7, 2013 Oct.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23975140
13.
A composite genome approach to identify phylogenetically informative data from next-generation sequencing.
BMC Bioinformatics
; 16: 193, 2015 Jun 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26062548
14.
A family-based probabilistic method for capturing de novo mutations from high-throughput short-read sequencing data.
Stat Appl Genet Mol Biol
; 11(2)2012 Jan 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-22499693
15.
Bifidobacteria define gut microbiome profiles of golden lion tamarin (Leontopithecus rosalia) and marmoset (Callithrix sp.) metagenomic shotgun pools.
Sci Rep
; 13(1): 15679, 2023 09 21.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37735195
16.
Expanding the stdpopsim species catalog, and lessons learned for realistic genome simulations.
Elife
; 122023 06 21.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37342968
17.
Neutral evolution of robustness in Drosophila microRNA precursors.
Mol Biol Evol
; 28(7): 2115-23, 2011 Jul.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21285032
18.
History can matter: non-Markovian behavior of ancestral lineages.
Syst Biol
; 60(3): 276-90, 2011 May.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21398626
19.
Federated learning and Indigenous genomic data sovereignty.
Nat Mach Intell
; 4(11): 909-911, 2022 Nov.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36504698
20.
Genie: an interactive real-time simulation for teaching genetic drift.
Evolution (N Y)
; 152022.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36237301