Detalhe da pesquisa
1.
An integrated SAGA and TFIID PIC assembly pathway selective for poised and induced promoters.
Genes Dev
; 36(17-18): 985-1001, 2022 09 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36302553
2.
Understanding nucleosome dynamics and their links to gene expression and DNA replication.
Nat Rev Mol Cell Biol
; 18(9): 548-562, 2017 Sep.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28537572
3.
A high-resolution protein architecture of the budding yeast genome.
Nature
; 592(7853): 309-314, 2021 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33692541
4.
Genome-wide promoter assembly in E. coli measured at single-base resolution.
Genome Res
; 32(5): 878-892, 2022 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35483960
5.
GenoPipe: identifying the genotype of origin within (epi)genomic datasets.
Nucleic Acids Res
; 51(22): 12054-12068, 2023 Dec 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37933851
6.
A ChIP-exo screen of 887 Protein Capture Reagents Program transcription factor antibodies in human cells.
Genome Res
; 31(9): 1663-1679, 2021 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34426512
7.
STENCIL: A web templating engine for visualizing and sharing life science datasets.
PLoS Comput Biol
; 18(2): e1009859, 2022 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35139076
8.
Genome-wide determinants of sequence-specific DNA binding of general regulatory factors.
Genome Res
; 28(4): 497-508, 2018 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29563167
9.
Genome-wide uniformity of human 'open' pre-initiation complexes.
Genome Res
; 27(1): 15-26, 2017 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27927716
10.
Characterizing protein-DNA binding event subtypes in ChIP-exo data.
Bioinformatics
; 35(6): 903-913, 2019 03 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30165373
11.
Iron-responsive chromatin remodelling and MAPK signalling enhance adhesion in Candida albicans.
Mol Microbiol
; 93(2): 291-305, 2014 Jul.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24889932
12.
An integrative approach to understanding the combinatorial histone code at functional elements.
Bioinformatics
; 29(18): 2231-7, 2013 Sep 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23821650
13.
Chromatin architectures at fission yeast transcriptional promoters and replication origins.
Nucleic Acids Res
; 40(15): 7176-89, 2012 Aug.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-22573177
14.
ArchTEx: accurate extraction and visualization of next-generation sequence data.
Bioinformatics
; 28(7): 1021-3, 2012 Apr 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-22302569
15.
Joint sequence & chromatin neural networks characterize the differential abilities of Forkhead transcription factors to engage inaccessible chromatin.
bioRxiv
; 2023 Oct 31.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37873361
16.
PEGR: a flexible management platform for reproducible epigenomic and genomic research.
Genome Biol
; 23(1): 99, 2022 04 19.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35440038
17.
Acute stress drives global repression through two independent RNA polymerase II stalling events in Saccharomyces.
Cell Rep
; 34(3): 108640, 2021 01 19.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33472084
18.
Universal promoter scanning by Pol II during transcription initiation in Saccharomyces cerevisiae.
Genome Biol
; 21(1): 132, 2020 06 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32487207
19.
Simplified ChIP-exo assays.
Nat Commun
; 9(1): 2842, 2018 07 20.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30030442
20.
Correspondence: DNA shape is insufficient to explain binding.
Nat Commun
; 8: 15643, 2017 06 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28580956