Detalhe da pesquisa
1.
Themisto: a scalable colored k-mer index for sensitive pseudoalignment against hundreds of thousands of bacterial genomes.
Bioinformatics
; 39(39 Suppl 1): i260-i269, 2023 06 30.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37387143
2.
Exploring the pediatric nasopharyngeal bacterial microbiota with culture-based MALDI-TOF mass spectrometry and targeted metagenomic sequencing.
mBio
; 15(6): e0078424, 2024 Jun 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38682956
3.
Deep sequencing of Escherichia coli exposes colonisation diversity and impact of antibiotics in Punjab, Pakistan.
Nat Commun
; 15(1): 5196, 2024 Jun 18.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38890378
4.
A Novel Prophage-like Insertion Element within yabG Triggers Early Entry into Sporulation in Clostridium botulinum.
Viruses
; 15(12)2023 12 14.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38140671
5.
Genomic and Phenotypic Characterization of Clostridium botulinum Isolates from an Infant Botulism Case Suggests Adaptation Signatures to the Gut.
mBio
; 13(3): e0238421, 2022 06 28.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35499308
6.
Strong pathogen competition in neonatal gut colonisation.
Nat Commun
; 13(1): 7417, 2022 12 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36456554
7.
Bacterial genomic epidemiology with mixed samples.
Microb Genom
; 7(11)2021 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34779765
8.
Closing Clostridium botulinum Group III Genomes Using Long-Read Sequencing.
Microbiol Resour Announc
; 10(22): e0136420, 2021 Jun 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34080898
9.
High-resolution sweep metagenomics using fast probabilistic inference.
Wellcome Open Res
; 5: 14, 2020.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34746439
10.
Identifying Bacterial Strains from Sequencing Data.
Methods Mol Biol
; 1807: 1-7, 2018.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30030799