Random regression models in the evaluation of the growth curve of Simbrasil beef cattle.

Random regression models were used to estimate the types and orders of random effects of (co)variance functions in the description of the growth trajectory of the Simbrasil cattle breed. Records for 7049 animals totaling 18,677 individual weighings were submitted to 15 models from the third to the fifth order including as fixed effects sex, contemporary group, feeding regimen, and type of reproduction and as random effects additive direct genetic effect, animal permanent environment, maternal additive genetic effect, and maternal permanent environment. The best-fit model presented order five to additive direct genetic effect, animal permanent environment, and maternal additive effect, with 6 classes of residual variances, and the maternal permanent environment effect was not significant, likely owing to the low average number of calves per cow. However, the model chosen for the growth curve presents three classes of residual variances, because even not showing the best fit it is more parsimonious, in addition to promoting a more realistic estimate of heritability.

Influence of animals obtained using embryo transfer on the genetic evaluation of growth in Simmental beef cattle with random regression models.

Weight records of Simmental beef cattle were used in a genetic evaluation of growth with and without embryo transfer (ET). A random regression model in which ET individuals were excluded (RRM1) contained 29,510 records from 10,659 animals, while another model that did not exclude these animals (RRM2) contained 62,895 records from 23,160 animals. The fixed and random regressions were represented by continuous functions, and a model with an order of three for the fixed curve and random effects was used to consider the homogeneity of residual variance. In general, the (co)variance components were similar in both models, except the maternal permanent environment and residual components. The direct heritability in RRM1 and RRM2 showed the same behavior with oscillations along the growth curve and were slightly higher in RRM1. Generally, the estimated correlations were the same and smaller as the ages distanced themselves. The inclusion of animals from ET in genetic evaluations can be done using random regression models; the inclusion of these animals would provide potential accuracy gains and greater genetic gains per unit time because of the reduction in the generation interval from the use of this reproductive technique.

Genetic evaluation using multi-trait and random regression models in Simmental beef cattle.

The Brazilian Association of Simmental and Simbrasil Cattle Farmers provided 29,510 records from 10,659 Simmental beef cattle; these were used to estimate (co)variance components and genetic parameters for weights in the growth trajectory, based on multi-trait (MTM) and random regression models (RRM). The (co)variance components and genetic parameters were estimated by restricted maximum likelihood. In the MTM analysis, the likelihood ratio test was used to determine the significance of random effects included in the model and to define the most appropriate model. All random effects were significant and included in the final model. In the RRM analysis, different adjustments of polynomial orders were compared for 5 different criteria to choose the best fit model. An RRM of third order for the direct additive genetic, direct permanent environmental, maternal additive genetic, and maternal permanent environment effects was sufficient to model variance structures in the growth trajectory of the animals. The (co)variance components were generally similar in MTM and RRM. Direct heritabilities of MTM were slightly lower than RRM and varied from 0.04 to 0.42 and 0.16 to 0.45, respectively. Additive direct correlations were mostly positive and of high magnitude, being highest at closest ages. Considering the results and that pre-adjustment of the weights to standard ages is not required, RRM is recommended for genetic evaluation of Simmental beef cattle in Brazil.

Componentes de(co)variância e parâmetros genéticos de características de crescimento da raça Simental no Brasil / Variance components and genetic parameters estimates for growth traits of Simmental cattle in Brazil

Informaçöes de genealogia e produçäo, cedidas pela Associaçäo Brasileira de Criadores da Raça Simental (ABCRS), relativas aos pesos desde o nascimento até um ano de idade, foram utilizadas para estimar, sob modelos alternativos, os componentes de variância e os parâmetros genéticos em animais da raça Simental no Brasil. A matriz de parentesco inclui 25.812 animais dos quais 7587 com dados de produçäo. O modelo 1 contém, além do erro, o efeito genético direto. Os modelos seguintes contêm os componentes do modelo 1, mais o efeito permanente de ambiente materno (modelo 2), ou o componente genético materno (modelo 3), ambos os componentes (modelo 5), os componentes do modelo 3 mais a covariância entre os efeitos genéticos direto e materno (modelo 4) e todos os componentes citados (modelo 6). Os modelos foram comparados pelo teste de razäo de verossimilhança pelo x2 (P<0,01). Os componentes de variância e os valores de herdabilidades, estimados para os efeitos direto e materno, foram decrescentes, desde o modelo 1 até o modelo 6, na razäo direta em que o modelo incorpora mais efeitos aleatórios. Para a fase de aleitamento foi encontrada variância genética nula, entretanto, alto valor para a variância de ambiente permanente. Os efeitos maternos, genético e de ambiente permanente säo importantes para a raça Simental no Brasil e devem ser considerados em programas de seleçäo. Entretanto, os valores mais elevados de herdabilidade materna,encontrados com modelos sem efeito de ambiente permanente, sugerem que o método utilizado näo discrimina apropriadamente esses efeitos, oriundos de mesma fonte de variaçäo

Análise de características de crescimento da raça simental / Analyse of growth traits in Simmental breed in Brazil

Registros de pesos ao nascimento, aos 100, 205, 365 e 550 dias de idade, de 7587 animais controlados pela Associaçäo Brasileira de Criadores da Raça Simental, criados em 150 fazendas e em diversos estados do Brasil, foram usados para estimar os componentes de variância e os parâmetros genéticos dessas características. O peso padronizado aos 205 dias (desmama) foi usado como característica "âncora". O aplicativo MTDFREML, sob modelo animal completo, foi utilizado para análise dos dados. As estimativas de herdabilidades total, direta e materna e as correlaçöes genéticas entre os efeitos materno e direto e os maternos permanentes foram obtidas mediante análises bicaracterísticas. Os seguintes valores foram encontrados: 0,23, 0,22, 0,05, -0,10, 0,07 para peso ao nascer; 0,09, 0,08, 0,00, 0,85, 0,17 para peso aos 100 dias de idade; 0,13, 0,13, 0,05, -0,17, 0,02 para peso aos 205 dias de idade; 0,15, 0,19, 0,06, -0,41, 0,03 para peso aos 365 dias de idade. A herdabilidade direta estimada para o peso aos 550 dias de idade, na análise bicaracterística com o peso à desmama, foi de 0,24. Exceto para peso ao nascimento (moderado), as correlaçöes genética, fenotípica e ambiente entre peso à desmama e as outras características foram altas e positivas. Os efeitos maternos foram importantes e devem ser incluídos nos programas de melhoramento da raça Simental