Detalhe da pesquisa
1.
Evolutionarily informed deep learning methods for predicting relative transcript abundance from DNA sequence.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 116(12): 5542-5549, 2019 03 19.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30842277
2.
Unraveling the KNOTTED1 regulatory network in maize meristems.
Genes Dev
; 26(15): 1685-90, 2012 Aug 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-22855831
3.
A k-mer grammar analysis to uncover maize regulatory architecture.
BMC Plant Biol
; 19(1): 103, 2019 Mar 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30876396
4.
Identification and Characterization of Maize salmon silks Genes Involved in Insecticidal Maysin Biosynthesis.
Plant Cell
; 28(6): 1297-309, 2016 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27221383
5.
Core Promoter Plasticity Between Maize Tissues and Genotypes Contrasts with Predominance of Sharp Transcription Initiation Sites.
Plant Cell
; 27(12): 3309-20, 2015 Dec.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26628745
6.
The Maize TFome--development of a transcription factor open reading frame collection for functional genomics.
Plant J
; 80(2): 356-66, 2014 Oct.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25053252
7.
Large-scale transcriptional profiling of lignified tissues in Tectona grandis.
BMC Plant Biol
; 15: 221, 2015 Sep 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26369560
8.
A genome-wide regulatory framework identifies maize pericarp color1 controlled genes.
Plant Cell
; 24(7): 2745-64, 2012 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-22822204
9.
From plant gene regulatory grids to network dynamics.
Biochim Biophys Acta
; 1819(5): 454-65, 2012 May.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-22406342
10.
AGRIS: the Arabidopsis Gene Regulatory Information Server, an update.
Nucleic Acids Res
; 39(Database issue): D1118-22, 2011 Jan.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21059685
11.
Emergence of switch-like behavior in a large family of simple biochemical networks.
PLoS Comput Biol
; 7(5): e1002039, 2011 May.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21589886
12.
Assessing the regulatory potential of transposable elements using chromatin accessibility profiles of maize transposons.
Genetics
; 217(1): 1-13, 2021 03 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33683350
13.
Reconstructing the maize leaf regulatory network using ChIP-seq data of 104 transcription factors.
Nat Commun
; 11(1): 5089, 2020 10 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33037196
14.
Author Correction: Widespread long-range cis-regulatory elements in the maize genome.
Nat Plants
; 6(3): 328, 2020 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32029893
15.
Widespread long-range cis-regulatory elements in the maize genome.
Nat Plants
; 5(12): 1237-1249, 2019 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31740773
16.
Genome-Wide TSS Identification in Maize.
Methods Mol Biol
; 1830: 239-256, 2018.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30043374
17.
Author Correction: Reconstructing the maize leaf regulatory network using ChIP-seq data of 104 transcription factors.
Nat Commun
; 14(1): 1586, 2023 Mar 22.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36949151
18.
A Maize Gene Regulatory Network for Phenolic Metabolism.
Mol Plant
; 10(3): 498-515, 2017 03 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27871810
19.
In silico identification of regulatory elements of GRIN1 genes.
OMICS
; 9(1): 106-15, 2005.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-15805781
20.
Important biological information uncovered in previously unaligned reads from chromatin immunoprecipitation experiments (ChIP-Seq).
Sci Rep
; 5: 8635, 2015 Mar 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25727450