Detalhe da pesquisa
1.
Natural mutagenesis of human genomes by endogenous retrotransposons.
Cell
; 141(7): 1253-61, 2010 Jun 25.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-20603005
2.
eCOMPASS: evaluative comparison of multiple protein alignments by statistical score.
Bioinformatics
; 37(20): 3456-3463, 2021 Oct 25.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33983436
3.
IntAPT: integrated assembly of phenotype-specific transcripts from multiple RNA-seq profiles.
Bioinformatics
; 37(5): 650-658, 2021 05 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33016988
4.
ChIP-GSM: Inferring active transcription factor modules to predict functional regulatory elements.
PLoS Comput Biol
; 17(7): e1009203, 2021 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34292930
5.
Identifying Function Determining Residues in Neuroimmune Semaphorin 4A.
Int J Mol Sci
; 23(6)2022 Mar 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35328445
6.
ChIP-BIT2: a software tool to detect weak binding events using a Bayesian integration approach.
BMC Bioinformatics
; 22(1): 193, 2021 Apr 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33858322
7.
A survey of TIR domain sequence and structure divergence.
Immunogenetics
; 72(3): 181-203, 2020 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32002590
8.
Statistical investigations of protein residue direct couplings.
PLoS Comput Biol
; 14(12): e1006237, 2018 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30596639
9.
Correction to: A survey of TIR domain sequence and structure divergence.
Immunogenetics
; 74(2): 269, 2022 Apr.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34977974
10.
Inference of Functionally-Relevant N-acetyltransferase Residues Based on Statistical Correlations.
PLoS Comput Biol
; 12(12): e1005294, 2016 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28002465
11.
Bayesian Top-Down Protein Sequence Alignment with Inferred Position-Specific Gap Penalties.
PLoS Comput Biol
; 12(5): e1004936, 2016 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27192614
12.
Identification and classification of small molecule kinases: insights into substrate recognition and specificity.
BMC Evol Biol
; 16: 7, 2016 Jan 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26738562
13.
Protein domain hierarchy Gibbs sampling strategies.
Stat Appl Genet Mol Biol
; 13(4): 497-517, 2014 Aug.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24988248
14.
Automated hierarchical classification of protein domain subfamilies based on functionally-divergent residue signatures.
BMC Bioinformatics
; 13: 144, 2012 Jun 22.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-22726767
15.
Surveying the manifold divergence of an entire protein class for statistical clues to underlying biochemical mechanisms.
Stat Appl Genet Mol Biol
; 10: Article 36, 2011.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-22331370
16.
The CHAIN program: forging evolutionary links to underlying mechanisms.
Trends Biochem Sci
; 32(11): 487-93, 2007 Nov.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-17962021
17.
SPARC: Structural properties associated with residue constraints.
Comput Struct Biotechnol J
; 20: 1702-1715, 2022.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35495120
18.
Bayesian shadows of molecular mechanisms cast in the light of evolution.
Trends Biochem Sci
; 31(7): 374-82, 2006 Jul.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-16766187
19.
Identifying intracellular signaling modules and exploring pathways associated with breast cancer recurrence.
Sci Rep
; 11(1): 385, 2021 01 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33432018
20.
A Bayesian approach for accurate de novo transcriptome assembly.
Sci Rep
; 11(1): 17663, 2021 09 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34480063