Multi-institutional experience of genetic diagnosis in Ecuador: National registry of chromosome alterations and polymorphisms.

BACKGROUND: Detection of chromosomal abnormalities is crucial in various medical areas; to diagnose birth defects, genetic disorders, and infertility, among other complex phenotypes, in individuals across a wide range of ages. Hence, the present study wants to contribute to the knowledge of type and frequency of chromosomal alterations and polymorphisms in Ecuador. METHODS: Cytogenetic registers from different Ecuadorian provinces have been merged and analyzed to construct an open-access national registry of chromosome alterations and polymorphisms. RESULTS: Of 28,806 karyotypes analyzed, 6,008 (20.9%) exhibited alterations. Down syndrome was the most frequent autosome alteration (88.28%), followed by Turner syndrome (60.50%), a gonosome aneuploidy. A recurrent high percentage of Down syndrome mosaicism (7.45%) reported here, as well as by previous Ecuadorian preliminary registries, could be associated with geographic location and admixed ancestral composition. Translocations (2.46%) and polymorphisms (7.84%) were not as numerous as autosomopathies (64.33%) and gonosomopathies (25.37%). Complementary to conventional cytogenetics tests, molecular tools have allowed identification of submicroscopic alterations regions or candidate genes which can be possibly implicated in patients' symptoms and phenotypes. CONCLUSION: The Ecuadorian National Registry of Chromosome Alterations and Polymorphisms provides a baseline to better understand chromosomal abnormalities in Ecuador and therefore their clinical management and awareness. This data will guide public policy makers to promote and financially support cytogenetic and genetic testing.

Analysis of the polymorphism [gIVS12-6T > C] in the hMSH2 gene in lymphoma and leukemia.

Given the importance of mismatch repairing genes in keeping the genetic stability in cells, any alterations in their structure or function could generate instability in the genome and predispose the development of oncogenic processes. hMSH2 is the principal gene involved in the post-replicating DNA mismatch repair system. In this study, exon 13 of the hMSH2 gene was analyzed in different neoplasias, leukemias and lymphomas. The aim of our work was to determine the association between the presence of polymorphisms in this region with the development of alterations in the hematological system. The 227 samples including lymphoma, leukemia and myelodysplasic syndromes, where analyzed by PCR-SSCP followed by automated sequencing. A single nucleotide polymorphism was found in 30 individuals. This polymorphism is a T to C substitution at the -6 intronic splice acceptor site of exon 13 of hMSH2 gene [gIVS12-6T > C]. In the lymphoma group the polymorphism frequency found was 0.09, with statistical significant differences (p < 0.01) when compared to the control group. On the other hand, the frequency of the leukemia group was the same of that of the control group (0.05). These findings agree with previous research results of other investigation groups. The results suggest a probable association of the polymorphism with the development of lymphomas but not with leukemia.

Examenes citogenéticos en oncología / Citogenéticos examinations in oncología

Analiza que el desarrollo de nuevas tecnologías en el diagnóstico del cáncer, ha determinado que el Instituto de Solca Núcleo de Quito, incorpore el servicio de genética, para cubrir las necesidades de diagnóstico citogenético en trastornos tumorales y neooplasias, especialmente las de origen hematológico y linfoproliferativo. El examen citogenético se utiliza, específicamente en oncología para detectar marcadores tumorales, también para valorar fragilidad cromosómica en pacientes expuestos a genotóxicos, radioterapia, quimioterapia y otros; además para el diagnóstico de malignidad en efusiones; diagnóstico, pronóstico y evolución de marcadores en médula ósea y tumores sólidos. En procesos leucémicos la existencia de anomalías estructurales o numéricas se asocia de manera no aleatoria a los diversos desórdenes hematológicos, constituyendo un interesante campo de estudio que permite establecer criterios válidos para el diagnóstico, tratamiento y pronóstico de los pacientes en estudio...

Infección por papiloma virus humano (HPV) cervico-uterino: citomorfología-grupo I-II-III servicio de citología-Solca núcleo de Quito

Los autores hacen un estudio de los caracteres estructurales y bioevolutivos del HPV cervicouterino. Sobre esta base formulan 3 agrupaciones con la esperanza de sistematizar la dificil y heterogenea patología producida por el HPV. Enfatizan que las mujeres portadoras del HPV de alto riesgo serán cuidadosamente manejados por el oncologo y, por el contrario, las mujeres portadoras del HPV de bajo riesgo no deberían ser alarmadas, pues el 95 por ciento de los casos regresionan a la normalidad espontaneamente. Indican además que estudios posteriores comparativos de los tres grupos con técnicas de hibridación serían recomendables.

Diagnóstico de efusiones mediante análisis cromosómico / Diagnosis of effusion by means of chromosomal analysis

Analiza citogenéticamente y citológicamente 100 efusiones con diferentes patologías en pacientes de Solca, Núcleo de Quito, a partir de 1985 a 1997, cuya edad fluctúa entre 14 y 90 años, el 80xciento correspondió a tumores malignos (adenocarcinomas 52, linfomas 10, carcinomas escamosos 7, carcinomas poco diferenciados 4 y sarcomas 4 y; el 20xciento a procesos inflamatorios y negativos para malignidad, de las cuales 68 son derrames pleurales, 31 líquidos ascíticos y un pericárdico; siendo 71 pacientes del sexo femenino y 29 del masculino; correspondiendo a 19 casos de lesiones de ovario, 19 de pulmón, 16 de estómago, 11 de mama, 10 linfomas, 6 de cérvix, 2 de riñón, 2 de costillas y los 15 casos restantes de boca, esófago, húmero, hígado, fémur, colon, recto, incluyendo 8 casos de origen primario desconocido...

Estudio molecular del oncogen bcr-abl en leucemia mieloide crónica y linfoblastica aguda / Molecular study of oncogen bcr-abl in acute chronic and linfoblástica leukemia mieloide

Expone que han usado la reacción en cadena de la polimerasa en su modalidad RT-PCR anidado, para observar el comportamiento del oncogen quimérico bcr-abl en leucemias, a partir del análisis de su ARN mensajero. Estudios previos han demostrado que la sensitividad de esta técnica puede detectar incluso una célula leucémica entre 1 millón de células sanas. Se analizaron 29 muestras de médula ósea, 18 de leucemia mieloide crónica )LMC) y 11 de leucemia linfobástica aguda. Todas a través de un análisis citogenético y molecular. Se cuidó que las muestras provengan de individuos que al momento no estén recibiendo tratamiento. Los hallazgos citogenéticos mostraron un 50xciento (9 de 18) la presencia de cromosoma filadelfia en LMC y ningún caso en LLA. Por otro lado el análisis molecular demostró la presencia del oncogen en 72xciento (13 de 18) de las LMC: 54xciento del tipo b2a2, 46xciento del tipo b3a2, y 27xciento (3 de 11) de las LLA del tipo b1 a 2...

Estudio citogenético en individuos con Síndrome de Klinefelter / citogenético Study in individuals with syndrome of Klinefelter

El Síndrome de Klinefelter (SK) afecta a aproximadamente 1 de cada 1000 varones nacidos vivos y se produce por la prescencia de más de un cromosoma X. Si bien el cariotipo característico de este desorden es 47,XXY existen otras variantes menos comunes. En este estudio se presenta el análisis citogenético realizado en linfocitos de sangre periférica de veinte y tres individuos afectados de SK, con el objeto de determinar las avriantes de este desorden genético. Se encotró que el 69,6 por ciento de individuos afectos presentan el carotipo 47,XXY; el 17 por ciento presentó mosaicos: 46,XY/47,XXY: y el restante 13 por ciento otras variantes: 46,XY/47,XXY,+microcromosoma (?); 48,XXYY: 49,XXXXY...