Detalhe da pesquisa
1.
BIreactive: A Machine-Learning Model to Estimate Covalent Warhead Reactivity.
J Chem Inf Model
; 60(6): 2915-2923, 2020 06 22.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32250627
2.
Accurate and Rigorous Prediction of the Changes in Protein Free Energies in a Large-Scale Mutation Scan.
Angew Chem Int Ed Engl
; 55(26): 7364-8, 2016 06 20.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27122231
3.
pmx: Automated protein structure and topology generation for alchemical perturbations.
J Comput Chem
; 36(5): 348-54, 2015 Feb 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25487359
4.
The impact of data integrity on decision making in early lead discovery.
J Comput Aided Mol Des
; 29(9): 911-21, 2015 Sep.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26409840
5.
Computational method to identify druggable binding sites that target protein-protein interactions.
J Chem Inf Model
; 54(5): 1391-400, 2014 May 27.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24762202
6.
A designed conformational shift to control protein binding specificity.
Angew Chem Int Ed Engl
; 53(39): 10367-71, 2014 Sep 22.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25115701
7.
Molecular structure of human GM-CSF in complex with a disease-associated anti-human GM-CSF autoantibody and its potential biological implications.
Biochem J
; 447(2): 205-15, 2012 Oct 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-22839360
8.
Towards computational specificity screening of DNA-binding proteins.
Nucleic Acids Res
; 39(19): 8281-90, 2011 Oct.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21737424
9.
ADMET Predictability at Boehringer Ingelheim: State-of-the-Art, and Do Bigger Datasets or Algorithms Make a Difference?
Mol Inform
; 41(2): e2100113, 2022 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34473408
10.
Evaluating the use of absolute binding free energy in the fragment optimisation process.
Commun Chem
; 5(1): 105, 2022 Sep 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36697714
11.
An adapted consensus protein design strategy for identifying globally optimal biotherapeutics.
MAbs
; 14(1): 2073632, 2022.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35613320
12.
Conformational transitions upon ligand binding: holo-structure prediction from apo conformations.
PLoS Comput Biol
; 6(1): e1000634, 2010 Jan.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-20066034
13.
Protein thermostability calculations using alchemical free energy simulations.
Biophys J
; 98(10): 2309-16, 2010 May 19.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-20483340
14.
Ligand docking and binding site analysis with PyMOL and Autodock/Vina.
J Comput Aided Mol Des
; 24(5): 417-22, 2010 May.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-20401516
15.
The molecular mechanism of toxin-induced conformational changes in a potassium channel: relation to C-type inactivation.
Structure
; 16(5): 747-54, 2008 May.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-18462679
16.
Hybrid Screening Approach for Very Small Fragments: X-ray and Computational Screening on FKBP51.
J Med Chem
; 63(11): 5856-5864, 2020 06 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32420743
17.
tCONCOORD-GUI: visually supported conformational sampling of bioactive molecules.
J Comput Chem
; 30(7): 1160-6, 2009 May.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-18942729
18.
Geometry-based sampling of conformational transitions in proteins.
Structure
; 15(11): 1482-92, 2007 Nov.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-17997973
19.
The thermodynamic influence of trapped water molecules on a protein-ligand interaction.
Angew Chem Int Ed Engl
; 48(28): 5207-10, 2009.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-19499554
20.
Fragment Binding Pose Predictions Using Unbiased Simulations and Markov-State Models.
J Chem Theory Comput
; 15(9): 4974-4981, 2019 Sep 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31402652