Detalhe da pesquisa
1.
Remnants of an Ancient Metabolism without Phosphate.
Cell
; 168(6): 1126-1134.e9, 2017 03 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28262353
2.
Protein cost minimization promotes the emergence of coenzyme redundancy.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 119(14): e2110787119, 2022 04 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35344442
3.
Environmental microbiome engineering for the mitigation of climate change.
Glob Chang Biol
; 29(8): 2050-2066, 2023 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36661406
4.
A thermodynamic atlas of carbon redox chemical space.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 117(52): 32910-32918, 2020 12 29.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33376214
5.
Growth instabilities shape morphology and genetic diversity of microbial colonies.
Phys Biol
; 19(5)2022 08 19.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35901792
6.
Stoichiometric Modeling of Artificial String Chemistries Reveals Constraints on Metabolic Network Structure.
J Mol Evol
; 89(7): 472-483, 2021 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34230992
7.
Particle-associated and free-living bacterial communities in an oligotrophic sea are affected by different environmental factors.
Environ Microbiol
; 23(8): 4295-4308, 2021 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34036706
8.
Visualization of Metabolic Interaction Networks in Microbial Communities Using VisANT 5.0.
PLoS Comput Biol
; 12(4): e1004875, 2016 Apr.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27081850
9.
Hierarchical expression of genes controlled by the Bacillus subtilis global regulatory protein CodY.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 111(22): 8227-32, 2014 Jun 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24843172
10.
Flux imbalance analysis and the sensitivity of cellular growth to changes in metabolite pools.
PLoS Comput Biol
; 9(8): e1003195, 2013.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24009492
11.
Detection of transcriptional triggers in the dynamics of microbial growth: application to the respiratorily versatile bacterium Shewanella oneidensis.
Nucleic Acids Res
; 40(15): 7132-49, 2012 Aug.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-22638572
12.
Epistatic interaction maps relative to multiple metabolic phenotypes.
PLoS Genet
; 7(2): e1001294, 2011 Feb 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21347328
13.
Modular epistasis in yeast metabolism.
Nat Genet
; 37(1): 77-83, 2005 Jan.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-15592468
14.
Multi-Attribute Subset Selection enables prediction of representative phenotypes across microbial populations.
Commun Biol
; 7(1): 407, 2024 Apr 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38570615
15.
Temporal expression-based analysis of metabolism.
PLoS Comput Biol
; 8(11): e1002781, 2012.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23209390
16.
COMBREX: a project to accelerate the functional annotation of prokaryotic genomes.
Nucleic Acids Res
; 39(Database issue): D11-4, 2011 Jan.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21097892
17.
The dynamics of hybrid metabolic-genetic oscillators.
Chaos
; 23(1): 013132, 2013 Mar.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23556969
18.
Metabolic complexity drives divergence in microbial communities.
bioRxiv
; 2023 Aug 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37577626
19.
Construction and Modeling of a Coculture Microplate for Real-Time Measurement of Microbial Interactions.
mSystems
; 8(2): e0001721, 2023 04 27.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36802169
20.
Inferring microbial co-occurrence networks from amplicon data: a systematic evaluation.
mSystems
; 8(4): e0096122, 2023 08 31.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37338270