Detalhe da pesquisa
1.
Efficient minimizer orders for large values of k using minimum decycling sets.
Genome Res
; 33(7): 1154-1161, 2023 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37558282
2.
Drugst.One - a plug-and-play solution for online systems medicine and network-based drug repurposing.
Nucleic Acids Res
; 2024 May 23.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38783119
3.
The predictive capacity of polygenic risk scores for disease risk is only moderately influenced by imputation panels tailored to the target population.
Bioinformatics
; 40(2)2024 02 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38265251
4.
Integration of gene expression and DNA methylation data across different experiments.
Nucleic Acids Res
; 51(15): 7762-7776, 2023 08 25.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37395437
5.
CT-FOCS: a novel method for inferring cell type-specific enhancer-promoter maps.
Nucleic Acids Res
; 50(10): e55, 2022 06 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35100425
6.
3CAC: improving the classification of phages and plasmids in metagenomic assemblies using assembly graphs.
Bioinformatics
; 38(Suppl_2): ii56-ii61, 2022 09 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36124804
7.
The DOMINO web-server for active module identification analysis.
Bioinformatics
; 38(8): 2364-2366, 2022 04 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35139202
8.
Parameterized syncmer schemes improve long-read mapping.
PLoS Comput Biol
; 18(10): e1010638, 2022 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36306319
9.
Sorting cancer karyotypes using double-cut-and-joins, duplications and deletions.
Bioinformatics
; 37(11): 1489-1496, 2021 Jul 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29726899
10.
DOMINO: a network-based active module identification algorithm with reduced rate of false calls.
Mol Syst Biol
; 17(1): e9593, 2021 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33471440
11.
Drosophila TRF2 is a preferential core promoter regulator.
Genes Dev
; 28(19): 2163-74, 2014 Oct 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25223897
12.
PRODIGY: personalized prioritization of driver genes.
Bioinformatics
; 36(6): 1831-1839, 2020 03 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31681944
13.
MONET: Multi-omic module discovery by omic selection.
PLoS Comput Biol
; 16(9): e1008182, 2020 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32931516
14.
PlasClass improves plasmid sequence classification.
PLoS Comput Biol
; 16(4): e1007781, 2020 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32243433
15.
Unravelling plasmidome distribution and interaction with its hosting microbiome.
Environ Microbiol
; 22(1): 32-44, 2020 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31602783
16.
NEMO: cancer subtyping by integration of partial multi-omic data.
Bioinformatics
; 35(18): 3348-3356, 2019 09 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30698637
17.
Inaccuracy of the log-rank approximation in cancer data analysis.
Mol Syst Biol
; 15(8): e8754, 2019 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31464374
18.
Using the kinetics of C-reactive protein response to improve the differential diagnosis between acute bacterial and viral infections.
Infection
; 48(2): 241-248, 2020 Apr.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31873850
19.
Modelling and analysis of gene regulatory networks.
Nat Rev Mol Cell Biol
; 9(10): 770-80, 2008 Oct.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-18797474
20.
Multi-omic and multi-view clustering algorithms: review and cancer benchmark.
Nucleic Acids Res
; 46(20): 10546-10562, 2018 11 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30295871