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1.
J Hum Genet ; 66(3): 333-338, 2021 Mar.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-32920601

RESUMO

The PAX6 is essential for ocular morphogenesis and is known to be highly sensitive to changes in gene expression, where neither over- nor under-expression ensures normal ocular development. Two unrelated probands with classical aniridia who were previously considered "PAX6-negative", were studied by whole-genome sequencing. Through the use of multiple in silico deep learning-based algorithms, we identified two novel putative causal mutations, c.-133_-132del in the 5' untranslated region (5'-UTR) and c.-52 + 5G>A in an intron upstream of the PAX6 gene. The luciferase activity was significantly increased and VAX2 binding was disrupted with the former 5'-UTR variant compared with wild-type sequence, which resulted in a striking overexpression of PAX6. The minigene assay showed that the c.-52 + 5G>A mutation caused defective splicing, which resulted in the formation of truncated transcripts.


Assuntos
Aniridia/genética , Mutação , Fator de Transcrição PAX6/genética , Regiões 5' não Traduzidas/genética , Algoritmos , Causalidade , Aprendizado Profundo , Ensaio de Desvio de Mobilidade Eletroforética , Olho/embriologia , Regulação da Expressão Gênica , Genes Reporter , Proteínas de Homeodomínio/metabolismo , Humanos , Íntrons/genética , Anotação de Sequência Molecular , Fator de Transcrição PAX6/biossíntese , Fator de Transcrição PAX6/fisiologia , Proteínas Recombinantes/genética , Deleção de Sequência , Sequenciamento Completo do Genoma
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