Detalhe da pesquisa
1.
A region-resolved proteomic map of the human brain enabled by high-throughput proteomics.
EMBO J
; 42(23): e114665, 2023 Dec 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37916885
2.
Mass spectrometry-based draft of the mouse proteome.
Nat Methods
; 19(7): 803-811, 2022 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35710609
3.
Illuminating phenotypic drug responses of sarcoma cells to kinase inhibitors by phosphoproteomics.
Mol Syst Biol
; 20(1): 28-55, 2024 Jan.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38177929
4.
Oktoberfest: Open-source spectral library generation and rescoring pipeline based on Prosit.
Proteomics
; 24(8): e2300112, 2024 Apr.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37672792
5.
Reanalysis of ProteomicsDB Using an Accurate, Sensitive, and Scalable False Discovery Rate Estimation Approach for Protein Groups.
Mol Cell Proteomics
; 21(12): 100437, 2022 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36328188
6.
SIMSI-Transfer: Software-Assisted Reduction of Missing Values in Phosphoproteomic and Proteomic Isobaric Labeling Data Using Tandem Mass Spectrum Clustering.
Mol Cell Proteomics
; 21(8): 100238, 2022 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35462064
7.
ProteomicsDB: toward a FAIR open-source resource for life-science research.
Nucleic Acids Res
; 50(D1): D1541-D1552, 2022 01 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34791421
8.
Triqler for Protein Summarization of Data from Data-Independent Acquisition Mass Spectrometry.
J Proteome Res
; 22(4): 1359-1366, 2023 04 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36988210
9.
Prosit-TMT: Deep Learning Boosts Identification of TMT-Labeled Peptides.
Anal Chem
; 94(20): 7181-7190, 2022 05 24.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35549156
10.
Triqler for MaxQuant: Enhancing Results from MaxQuant by Bayesian Error Propagation and Integration.
J Proteome Res
; 20(4): 2062-2068, 2021 04 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33661646
11.
Evaluation of Disposable Trap Column nanoLC-FAIMS-MS/MS for the Proteomic Analysis of FFPE Tissue.
J Proteome Res
; 20(12): 5402-5411, 2021 12 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34735149
12.
Identification of 7â¯000-9â¯000 Proteins from Cell Lines and Tissues by Single-Shot Microflow LC-MS/MS.
Anal Chem
; 93(25): 8687-8692, 2021 06 29.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34124897
13.
Integrated Identification and Quantification Error Probabilities for Shotgun Proteomics.
Mol Cell Proteomics
; 18(3): 561-570, 2019 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30482846
14.
Speeding Up Percolator.
J Proteome Res
; 18(9): 3353-3359, 2019 09 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31407580
15.
Response to "Comparison and Evaluation of Clustering Algorithms for Tandem Mass Spectra".
J Proteome Res
; 17(5): 1993-1996, 2018 05 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29682973
16.
A Protein Standard That Emulates Homology for the Characterization of Protein Inference Algorithms.
J Proteome Res
; 17(5): 1879-1886, 2018 05 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29631402
17.
Uncertainty estimation of predictions of peptides' chromatographic retention times in shotgun proteomics.
Bioinformatics
; 33(4): 508-513, 2017 02 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27797755
18.
How to talk about protein-level false discovery rates in shotgun proteomics.
Proteomics
; 16(18): 2461-9, 2016 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27503675
19.
MaRaCluster: A Fragment Rarity Metric for Clustering Fragment Spectra in Shotgun Proteomics.
J Proteome Res
; 15(3): 713-20, 2016 Mar 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26653874
20.
Deep Learning-Assisted Analysis of Immunopeptidomics Data.
Methods Mol Biol
; 2758: 457-483, 2024.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38549030