Detalhe da pesquisa
1.
Merfin: improved variant filtering, assembly evaluation and polishing via k-mer validation.
Nat Methods
; 19(6): 696-704, 2022 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35361932
2.
HiCanu: accurate assembly of segmental duplications, satellites, and allelic variants from high-fidelity long reads.
Genome Res
; 30(9): 1291-1305, 2020 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32801147
3.
Weighted minimizer sampling improves long read mapping.
Bioinformatics
; 36(Suppl_1): i111-i118, 2020 07 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32657365
4.
Canu: scalable and accurate long-read assembly via adaptive k-mer weighting and repeat separation.
Genome Res
; 27(5): 722-736, 2017 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28298431
5.
Integrating Hi-C links with assembly graphs for chromosome-scale assembly.
PLoS Comput Biol
; 15(8): e1007273, 2019 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31433799
6.
An improved genome assembly uncovers prolific tandem repeats in Atlantic cod.
BMC Genomics
; 18(1): 95, 2017 01 18.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28100185
7.
Hybrid assembly with long and short reads improves discovery of gene family expansions.
BMC Genomics
; 18(1): 541, 2017 07 19.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28724409
8.
The genome of Anopheles darlingi, the main neotropical malaria vector.
Nucleic Acids Res
; 41(15): 7387-400, 2013 Aug.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23761445
9.
Telomere-to-telomere assembly of diploid chromosomes with Verkko.
Nat Biotechnol
; 41(10): 1474-1482, 2023 Oct.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36797493
10.
Genetic variation in an individual human exome.
PLoS Genet
; 4(8): e1000160, 2008 Aug 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-18704161
11.
The genomic structure of a human chromosome 22 nucleolar organizer region determined by TAR cloning.
Sci Rep
; 11(1): 2997, 2021 02 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33542373
12.
An algorithm for automated closure during assembly.
BMC Bioinformatics
; 11: 457, 2010 Sep 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-20831800
13.
The diploid genome sequence of an individual human.
PLoS Biol
; 5(10): e254, 2007 Sep 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-17803354
14.
Nanoliter reactors improve multiple displacement amplification of genomes from single cells.
PLoS Genet
; 3(9): 1702-8, 2007 Sep.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-17892324
15.
Merqury: reference-free quality, completeness, and phasing assessment for genome assemblies.
Genome Biol
; 21(1): 245, 2020 09 14.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32928274
16.
Effect of sequence depth and length in long-read assembly of the maize inbred NC358.
Nat Commun
; 11(1): 2288, 2020 05 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32385271
17.
Aggressive assembly of pyrosequencing reads with mates.
Bioinformatics
; 24(24): 2818-24, 2008 Dec 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-18952627
18.
Erratum: Author Correction: Improved reference genome for the domestic horse increases assembly contiguity and composition.
Commun Biol
; 2: 342, 2019.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31531403
19.
De novo assembly of haplotype-resolved genomes with trio binning.
Nat Biotechnol
; 2018 Oct 22.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30346939
20.
Improved reference genome for the domestic horse increases assembly contiguity and composition.
Commun Biol
; 1: 197, 2018.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30456315