Detalhe da pesquisa
1.
OpenFold: retraining AlphaFold2 yields new insights into its learning mechanisms and capacity for generalization.
Nat Methods
; 2024 May 14.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38744917
2.
Computationally-guided design and selection of high performing ribosomal active site mutants.
Nucleic Acids Res
; 50(22): 13143-13154, 2022 12 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36484094
3.
Computationally designed peptide macrocycle inhibitors of New Delhi metallo-ß-lactamase 1.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 118(12)2021 03 23.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33723038
4.
Accelerated cryo-EM-guided determination of three-dimensional RNA-only structures.
Nat Methods
; 17(7): 699-707, 2020 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32616928
5.
De novo 3D models of SARS-CoV-2 RNA elements from consensus experimental secondary structures.
Nucleic Acids Res
; 49(6): 3092-3108, 2021 04 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33693814
6.
Theoretical basis for stabilizing messenger RNA through secondary structure design.
Nucleic Acids Res
; 49(18): 10604-10617, 2021 10 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34520542
7.
Macrocyclic ß-Sheets Stabilized by Hydrogen Bond Surrogates.
Angew Chem Int Ed Engl
; 62(41): e202303943, 2023 10 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37170337
8.
RNA-Puzzles Round IV: 3D structure predictions of four ribozymes and two aptamers.
RNA
; 26(8): 982-995, 2020 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32371455
9.
Better together: Elements of successful scientific software development in a distributed collaborative community.
PLoS Comput Biol
; 16(5): e1007507, 2020 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32365137
10.
Structure and ligand binding of the glutamine-II riboswitch.
Nucleic Acids Res
; 47(14): 7666-7675, 2019 08 22.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31216023
11.
Protein Domain Mimics as Modulators of Protein-Protein Interactions.
Acc Chem Res
; 50(6): 1313-1322, 2017 06 20.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28561588
12.
Correction to 'Theoretical basis for stabilizing messenger RNA through secondary structure design'.
Nucleic Acids Res
; 49(19): 11405, 2021 Nov 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34591967
13.
Effects of side chains in helix nucleation differ from helix propagation.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 111(18): 6636-41, 2014 May 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24753597
14.
Side-Chain Conformational Preferences Govern Protein-Protein Interactions.
J Am Chem Soc
; 138(33): 10386-9, 2016 08 24.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27483190
15.
Protein-Protein Interactions Mediated by Helical Tertiary Structure Motifs.
J Am Chem Soc
; 137(36): 11622-30, 2015 Sep 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26302018
16.
HippDB: a database of readily targeted helical protein-protein interactions.
Bioinformatics
; 29(21): 2806-7, 2013 Nov 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23958730
17.
RNA 3D Modeling with FARFAR2, Online.
Methods Mol Biol
; 2586: 233-249, 2023.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36705908
18.
OpenProteinSet: Training data for structural biology at scale.
ArXiv
; 2023 Aug 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37608940
19.
Community science designed ribosomes with beneficial phenotypes.
Nat Commun
; 14(1): 961, 2023 02 21.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36810740
20.
Cryo-EM-guided engineering of T-box-tRNA modules with enhanced selectivity and sensitivity in translational regulation.
bioRxiv
; 2023 Mar 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36909519