Pesquisa | Portal de Pesquisa da BVS

1.

NeuroPAL: A Multicolor Atlas for Whole-Brain Neuronal Identification in C. elegans.

Yemini, Eviatar; Lin, Albert; Nejatbakhsh, Amin; Varol, Erdem; Sun, Ruoxi; Mena, Gonzalo E; Samuel, Aravinthan D T; Paninski, Liam; Venkatachalam, Vivek; Hobert, Oliver.

Cell ; 184(1): 272-288.e11, 2021 01 07.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-33378642

2.

Molecular topography of an entire nervous system.

Taylor, Seth R; Santpere, Gabriel; Weinreb, Alexis; Barrett, Alec; Reilly, Molly B; Xu, Chuan; Varol, Erdem; Oikonomou, Panos; Glenwinkel, Lori; McWhirter, Rebecca; Poff, Abigail; Basavaraju, Manasa; Rafi, Ibnul; Yemini, Eviatar; Cook, Steven J; Abrams, Alexander; Vidal, Berta; Cros, Cyril; Tavazoie, Saeed; Sestan, Nenad; Hammarlund, Marc; Hobert, Oliver; Miller, David M.

Cell ; 184(16): 4329-4347.e23, 2021 08 05.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-34237253

3.

Global brain dynamics embed the motor command sequence of Caenorhabditis elegans.

Kato, Saul; Kaplan, Harris S; Schrödel, Tina; Skora, Susanne; Lindsay, Theodore H; Yemini, Eviatar; Lockery, Shawn; Zimmer, Manuel.

Cell ; 163(3): 656-69, 2015 Oct 22.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-26478179

4.

Cell-specific effects of the sole C. elegans Daughterless/E protein homolog, HLH-2, on nervous system development.

Masoudi, Neda; Schnabel, Ralf; Yemini, Eviatar; Leyva-Díaz, Eduardo; Hobert, Oliver.

Development ; 150(1)2023 01 01.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-36595352

5.

Unique homeobox codes delineate all the neuron classes of C. elegans.

Reilly, Molly B; Cros, Cyril; Varol, Erdem; Yemini, Eviatar; Hobert, Oliver.

Nature ; 584(7822): 595-601, 2020 08.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-32814896

6.

Piecemeal regulation of convergent neuronal lineages by bHLH transcription factors in Caenorhabditis elegans.

Masoudi, Neda; Yemini, Eviatar; Schnabel, Ralf; Hobert, Oliver.

Development ; 148(11)2021 06 01.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-34100067

7.

Visualizing the organization and differentiation of the male-specific nervous system of C. elegans.

Tekieli, Tessa; Yemini, Eviatar; Nejatbakhsh, Amin; Wang, Chen; Varol, Erdem; Fernandez, Robert W; Masoudi, Neda; Paninski, Liam; Hobert, Oliver.

Development ; 148(18)2021 09 15.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-34415309

8.

Toward a more accurate 3D atlas of C. elegans neurons.

Skuhersky, Michael; Wu, Tailin; Yemini, Eviatar; Nejatbakhsh, Amin; Boyden, Edward; Tegmark, Max.

BMC Bioinformatics ; 23(1): 195, 2022 May 28.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-35643434

9.

The Multilayer Connectome of Caenorhabditis elegans.

Bentley, Barry; Branicky, Robyn; Barnes, Christopher L; Chew, Yee Lian; Yemini, Eviatar; Bullmore, Edward T; Vértes, Petra E; Schafer, William R.

PLoS Comput Biol ; 12(12): e1005283, 2016 12.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-27984591

10.

A database of Caenorhabditis elegans behavioral phenotypes.

Yemini, Eviatar; Jucikas, Tadas; Grundy, Laura J; Brown, André E X; Schafer, William R.

Nat Methods ; 10(9): 877-9, 2013 Sep.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-23852451

11.

An open-source platform for analyzing and sharing worm-behavior data.

Javer, Avelino; Currie, Michael; Lee, Chee Wai; Hokanson, Jim; Li, Kezhi; Martineau, Céline N; Yemini, Eviatar; Grundy, Laura J; Li, Chris; Ch'ng, QueeLim; Schafer, William R; Nollen, Ellen A A; Kerr, Rex; Brown, André E X.

Nat Methods ; 15(9): 645-646, 2018 09.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-30171234

12.

A dictionary of behavioral motifs reveals clusters of genes affecting Caenorhabditis elegans locomotion.

Brown, André E X; Yemini, Eviatar I; Grundy, Laura J; Jucikas, Tadas; Schafer, William R.

Proc Natl Acad Sci U S A ; 110(2): 791-6, 2013 Jan 08.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-23267063

13.

Eviatar Yemini.

Yemini, Eviatar.

Curr Biol ; 34(7): R263-R267, 2024 Apr 08.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-38593765

14.

Learning dynamic representations of the functional connectome in neurobiological networks.

Dyballa, Luciano; Lang, Samuel; Haslund-Gourley, Alexandra; Yemini, Eviatar; Zucker, Steven W.

ArXiv ; 2024 Feb 27.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-38463505

15.

Unifying community-wide whole-brain imaging datasets enables robust automated neuron identification and reveals determinants of neuron positioning in C. elegans.

Sprague, Daniel Y; Rusch, Kevin; Dunn, Raymond L; Borchardt, Jackson M; Bubnis, Greg; Chiu, Grace C; Wen, Chentao; Suzuki, Ryoga; Chaudhary, Shivesh; Dichter, Benjamin; Ly, Ryan; Onami, Shuichi; Lu, Hang; Kimura, Kotaro; Yemini, Eviatar I; Kato, Saul.

bioRxiv ; 2024 Apr 30.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-38746302

16.

Systems neuroscience: Foraging through serotonin's tangled web.

Yemini, Eviatar.

Curr Biol ; 33(14): R767-R770, 2023 07 24.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-37490863

17.

Learning Probabilistic Piecewise Rigid Atlases of Model Organisms via Generative Deep Networks.

Nejatbakhsh, Amin; Dey, Neel; Venkatachalam, Vivek; Yemini, Eviatar; Paninski, Liam; Varol, Erdem.

Inf Process Med Imaging ; 13939: 332-343, 2023 Jun.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-37476079

18.

Deep learning-based aberration compensation improves contrast and resolution in fluorescence microscopy.

Guo, Min; Wu, Yicong; Su, Yijun; Qian, Shuhao; Krueger, Eric; Christensen, Ryan; Kroeschell, Grant; Bui, Johnny; Chaw, Matthew; Zhang, Lixia; Liu, Jiamin; Hou, Xuekai; Han, Xiaofei; Ma, Xuefei; Zhovmer, Alexander; Combs, Christian; Moyle, Mark; Yemini, Eviatar; Liu, Huafeng; Liu, Zhiyi; La Riviere, Patrick; Colón-Ramos, Daniel; Shroff, Hari.

bioRxiv ; 2023 Oct 24.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-37986950

19.

Locomotion analysis identifies roles of mechanosensory neurons in governing locomotion dynamics of C. elegans.

Cohen, Emiliano; Yemini, Eviatar; Schafer, William; Feitelson, Dror G; Treinin, Millet.

J Exp Biol ; 215(Pt 20): 3639-48, 2012 Oct 15.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-22811252

20.

Neuropeptide signalling shapes feeding and reproductive behaviours in male Caenorhabditis elegans.

Gadenne, Matthew J; Hardege, Iris; Yemini, Eviatar; Suleski, Djordji; Jaggers, Paris; Beets, Isabel; Schafer, William R; Chew, Yee Lian.

Life Sci Alliance ; 5(10)2022 10.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-35738805

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