Assessing the global prevalence of wild birds in trade.

Trade represents a significant threat to many wild species and is often clandestine and poorly monitored. Information on which species are most prevalent in trade and potentially threatened by it therefore remains fragmentary. We used 7 global data sets on birds in trade to identify species or groups of species at particular risk and assessed the extent to which they were congruent in terms of the species recorded in trade. We used the frequency with which species were recorded in the data sets as the basis for a trade prevalence score that was applied to all bird species globally. Literature searches and questionnaire surveys were used to develop a list of species known to be heavily traded to validate the trade prevalence score. The score was modeled to identify significant predictors of trade. Although the data sets sampled different parts of the broad trade spectrum, congruence among them was statistically strong in all comparisons. Furthermore, the frequency with which species were recorded within data sets was positively correlated with their occurrence across data sets, indicating that the trade prevalence score captured information on trade volume. The trade prevalence score discriminated well between species identified from semi-independent assessments as heavily or unsustainably traded and all other species. Globally, 45.1% of all bird species and 36.7% of globally threatened bird species had trade prevalence scores ≥1. Species listed in Appendices I or II of CITES, species with large geographical distributions, and nonpasserines tended to have high trade prevalence scores. Speciose orders with high mean trade prevalence scores included Falconiformes, Psittaciformes, Accipitriformes, Anseriformes, Bucerotiformes, and Strigiformes. Despite their low mean prevalence score, Passeriformes accounted for the highest overall number of traded species of any order but had low representation in CITES appendices. Geographical hotspots where large numbers of traded species co-occur differed among passerines (Southeast Asia and Eurasia) and nonpasserines (central South America, sub-Saharan Africa, and India). This first attempt to quantify and map the relative prevalence in trade of all bird species globally can be used to identify species and groups of species that may be at particular risk of harm from trade and can inform conservation and policy interventions to reduce its adverse impacts.

Análisis de la prevalencia mundial de aves silvestres en el mercado Resumen El mercado representa una amenaza importante para muchas especies silvestres y a menudo es clandestino y mal vigilado. Por ello, la información sobre las especies más presentes en el mercado y bajo amenaza potencial todavía está fragmentada. Utilizamos siete conjuntos de datos mundiales sobre aves comercializadas para identificar especies o grupos de especies bajo riesgo especial y evaluamos hasta qué punto eran congruentes en cuanto a las especies registradas en el comercio. Utilizamos la frecuencia con la que las especies se registraban en los conjuntos de datos como base para una puntuación de prevalencia del comercio que se aplicó a todas las especies de aves a nivel mundial. Para validar la puntuación de prevalencia del comercio, realizamos búsquedas bibliográficas y cuestionarios para elaborar una lista de especies que se sabe son objeto de comercio intenso. Modelamos la puntuación para identificar los predictores significativos del mercado. Aunque los conjuntos de datos muestrearon partes distintas del amplio espectro del mercado, la congruencia entre ellos fue estadísticamente robusta en todas las comparaciones. Además, la frecuencia con la que se registraron las especies dentro de los conjuntos de datos se correlacionó positivamente con su presencia en todos los conjuntos de datos, lo que indica que la puntuación de prevalencia del mercado captó información sobre el volumen de este. La puntuación de prevalencia del mercado distinguió entre las especies identificadas a partir de evaluaciones semiindependientes como objeto de comercio intenso o insostenible y todas las demás especies. A nivel mundial, el 45.1% de todas las especies de aves y el 36.7% de las especies de aves amenazadas mundialmente tenían puntuaciones de prevalencia del mercado ≥1. Las especies incluidas en los Apéndices I o II de CITES, las especies con una amplia distribución geográfica y los no paseriformes tendieron a tener puntuaciones elevadas de prevalencia del mercado. Los órdenes de especies con puntuaciones medias de prevalencia del mercado elevadas fueron Falconiformes, Psittaciformes, Accipitriformes, Anseriformes, Bucerotiformes y Strigiformes. A pesar de su baja puntuación media de prevalencia, los Passeriformes representaron el mayor número total de especies comercializadas de todos los órdenes, pero tuvieron una baja representación en los apéndices de CITES. Los puntos calientes geográficos en los que coexisten un gran número de especies comercializadas difieren entre los paseriformes (Sudeste Asiático y Eurasia) y los no paseriformes (centro de Sudamérica, África subsahariana e India). Este primer intento de cuantificar y cartografiar la prevalencia relativa en el comercio de todas las especies de aves a escala mundial puede utilizarse para identificar especies y grupos de especies que pueden correr un riesgo especial de sufrir daños a causa del comercio y puede servir de base para intervenciones políticas y de conservación destinadas a reducir sus efectos adversos.

An expert-based system to predict population survival rate from health data.

Timely detection and understanding of causes for population decline are essential for effective wildlife management and conservation. Assessing trends in population size has been the standard approach, but we propose that monitoring population health could prove more effective. We collated data from 7 bottlenose dolphin (Tursiops truncatus) populations in the southeastern United States to develop a method for estimating survival probability based on a suite of health measures identified by experts as indices for inflammatory, metabolic, pulmonary, and neuroendocrine systems. We used logistic regression to implement the veterinary expert system for outcome prediction (VESOP) within a Bayesian analysis framework. We fitted parameters with records from 5 of the sites that had a robust network of responders to marine mammal strandings and frequent photographic identification surveys that documented definitive survival outcomes. We also conducted capture-mark-recapture (CMR) analyses of photographic identification data to obtain separate estimates of population survival rates for comparison with VESOP survival estimates. The VESOP analyses showed that multiple measures of health, particularly markers of inflammation, were predictive of 1- and 2-year individual survival. The highest mortality risk 1 year following health assessment related to low alkaline phosphatase (odds ratio [OR] = 10.2 [95% CI: 3.41-26.8]), whereas 2-year mortality was most influenced by elevated globulin (OR = 9.60 [95% CI: 3.88-22.4]); both are markers of inflammation. The VESOP model predicted population-level survival rates that correlated with estimated survival rates from CMR analyses for the same populations (1-year Pearson's r = 0.99, p = 1.52 × 10-5 ; 2-year r = 0.94, p = 0.001). Although our proposed approach will not detect acute mortality threats that are largely independent of animal health, such as harmful algal blooms, it can be used to detect chronic health conditions that increase mortality risk. Random sampling of the population is important and advancement in remote sampling methods could facilitate more random selection of subjects, obtainment of larger sample sizes, and extension of the approach to other wildlife species.

Un sistema basado en conocimiento experto para predecir la tasa de supervivencia a partir de datos de salud Resumen La detección y el entendimiento oportunos de la declinación poblacional son esenciales para que el manejo y la conservación de fauna tengan efectividad. La evaluación de las tendencias en el tamaño poblacional ha sido la estrategia estándar, pero proponemos que el monitoreo de la salud poblacional podría ser más efectivo. Recopilamos datos de siete poblaciones de delfines (Tursiops truncatus) en el sureste de Estados Unidos para desarrollar un método de estimación de la probabilidad de supervivencia con base en un conjunto de medidas sanitarias identificadas por expertos como índices para los sistemas inflamatorio, metabólico, pulmonar y neuroendocrino. Usamos la regresión logística para implementar el sistema de expertos veterinarios para la predicción de resultados (SEVPR) en un análisis bayesiano. Ajustamos los parámetros con los registros de cinco sitios que contaban con una buena red de respondientes a los varamientos de mamíferos marinos y censos de identificación fotográfica (foto-ID) que documentaron los resultados de supervivencia definitivos. También realizamos análisis de marcaje-recaptura (MR) en los datos de identificación fotográfica para obtener estimados separados de las tasas de supervivencia poblacional para compararlos con los estimados del SEVPR. Los análisis del SEVPR mostraron que varias medidas sanitarias, particularmente los marcadores de inflamación son buenos predictores de la supervivencia individual para uno y dos años. El riesgo de mortalidad más alto un año después de la valoración sanitaria se relacionó con una fosfatasa alcalina baja (cociente de probabilidades de 10.2 [95% CI 3.41-26.8]), mientras que la mortalidad a los dos años estuvo más influenciada por una globulina elevada (9.60 [95% CI 3.88-22.4]); ambas son marcadores de la inflamación. El modelo del SEVPR predijo las tasas de supervivencia a nivel poblacional en correlación con las tasas estimadas de supervivencia de los análisis de MR para las mismas poblaciones (Pearson de un año r = 0.99, p = 1.52e-05; dos años r = 0.94, p = 0.001). Aunque nuestra propuesta no detecta las amenazas agudas de mortalidad que en su mayoría son independientes de la salud animal, como la proliferación de algas nocivas, puede usarse para detectar las condiciones crónicas de salud que incrementan el riesgo de mortalidad. Es importante el muestreo aleatorio de la población y los avances en los métodos de muestreo remoto podrían facilitar una selección más aleatoria de los sujetos, la obtención de muestras de mayor tamaño y la expansión de la estrategia a otras especies de fauna.

Genetic erosion in an endangered desert fish during a megadrought despite long-term supportive breeding.

Human water use combined with a recent megadrought have reduced river and stream flow through the southwest United States and led to periodic drying of formerly perennial river segments. Reductions in snowmelt runoff and increased extent of drying collectively threaten short-lived, obligate aquatic species, including the endangered Rio Grande silvery minnow (Hybognathus amarus). This species is subject to boom-and-bust population dynamics, under which large fluctuations in abundance are expected to lower estimates of effective population size and erode genetic diversity over time. Rates of diversity loss are also affected by additions of hatchery-origin fish used to supplement the wild population. We used demographic and genetic data from wild and hatchery individuals to examine the relationship of genetic diversity and effective population size to abundance over the last two decades. Genetic diversity was low during the early 2000s, but diversity and demographic metrics stabilized after the hatchery program was initiated and environmental conditions improved. Yet, from 2017 onward, allelic diversity declined (Cohen's d = 1.34) and remained low despite hatchery stocking and brief wild population recovery. Across the time series, single-sample estimates of effective population size based on linkage disequilibrium (LD Ne ) were positively associated (r = 0.53) with wild abundance and total abundance, but as the proportion of hatchery-origin spawners increased, LD Ne declined (r = -0.55). Megadrought limited wild spawner abundance and precluded refreshment of hatchery brood stocks with wild fish; hence, we predict a riverine population increasingly dominated by hatchery-origin individuals and accelerated loss of genetic diversity despite supplementation. We recommend an adaptive and accelerated management plan that integrates river flow management and hatchery operations to slow the pace of genetic diversity loss exacerbated by megadrought.

El uso humano del agua, combinado con una megasequía reciente, ha reducido el flujo de los ríos y arroyos en el suroeste de los Estados Unidos y ha provocado la seca periódica de segmentos de ríos que antes eran perennes. Las reducciones en la escorrentía del deshielo y el aumento de la sequía amenazan colectivamente a especies obligatoriamente acuáticas de vida corta, incluyendo la amenazada carpa chamizal (Hybognathus amarus). Esta especie está sujeta a una dinámica poblacional de explosión y colapso, bajo la cual se espera que grandes fluctuaciones en la abundancia reduzcan las estimaciones del tamaño efectivo de la población y erosionen la diversidad genética con el tiempo. Las tasas de pérdida de la diversidad también se ven afectadas por la adición de peces procedentes de criaderos usados para suplementar la población silvestre. Utilizamos datos demográficos y genéticos de individuos silvestres y de criaderos para examinar la relación entre la diversidad genética y el tamaño efectivo de la población con la abundancia durante las últimas dos décadas. La diversidad genética fue baja a principios de los 2000, pero las métricas de diversidad y demografía estabilizaron después de que se inició el programa de criadero y mejoraron las condiciones ambientales. Sin embargo, a partir de 2017, la diversidad alélica disminuyó (d de Cohen = 1,34) y se mantuvo baja a pesar de la suplementación con individuos de criaderos y la breve recuperación de la población silvestre. A lo largo del tiempo, las estimativas de muestras individuales del tamaño efectivo de la población basados en el desequilibrio de ligamiento (LD Ne) estaban asociadas positivamente (r = 0,53) con la abundancia silvestre y la abundancia total, pero a medida que la proporción de desovadores originados en criaderos aumentó, el LD Ne disminuyó (r = -0,55). La megasequía limitó la abundancia de desovadores silvestres e impidió el reabastecimiento de las poblaciones en cautiverio con peces silvestres; por lo tanto, predecimos una población ribereña cada vez más dominada por individuos procedentes de criaderos y una pérdida acelerada de diversidad genética a pesar de la suplementación. Recomendamos un plan de gestión adaptativo y acelerado que integre la gestión del caudal del río y las operaciones de criaderos para frenar el ritmo de pérdida de diversidad genética exacerbada por la megasequía.

Lessons from COP15 on effective scientific engagement in biodiversity policy processes.

The Kunming-Montreal Global Biodiversity Framework was adopted by parties to the Convention on Biological Diversity in December 2022. The aftermath of these negotiations provides an opportunity to draw lessons as to how ecological and evolutionary science can more effectively inform policy. We examined key challenges that limit effective engagement by scientists in the biodiversity policy process, drawing parallels with analogous challenges within global climate negotiations. Biodiversity is multifaceted, yet represents only one framing for nature's contributions to people, complicating the nexus between evidence and values in development of the framework's targets. Processes generating biodiversity and driving its loss are multiscalar, challenging development of an evidence base for globally standardized targets. We illustrated these challenges by contrasting development of 2 key elements of the framework. The genetic diversity element of the framework's target 4 is directly related to the framework's primary goals, but its complexity required development of novel engagement skills. The target for protected areas was easily communicated but more indirectly related to biodiversity outcomes; evidence from ecological and social science was essential to communicating the context and limitations of this relationship. Scientists can strengthen the effectiveness of global agreements and address challenges arising from complexity, scaling, capacity limitations, and the interplay of science and values, if they can prioritize communication, consensus-building, and networking skills and engage throughout the process, from development of an evidence base to implementation.

Lecciones de la COP15 sobre la participación científica efectiva en los procesos políticos de biodiversidad Resumen El Marco Global de la Biodiversidad de Kunming­Montreal lo adoptaron los participantes de la Convención sobre la Diversidad Biológica en diciembre 2022. Las consecuencias de estas negociaciones proporcionan una oportunidad para tomar lecciones de cómo la ciencia evolutiva y ecológica puede orientar de mejor manera a las políticas. Examinamos los retos clave que limitan la participación efectiva de los científicos en el proceso de políticas de la biodiversidad, estableciendo paralelismos con los retos análogos en las negociaciones climáticas mundiales. La biodiversidad es multifacética y aun así representa sólo un marco para las contribuciones que tiene la naturaleza para las personas, lo que complica el nexo entre la evidencia y los valores en el desarrollo de los objetivos del marco. Los procesos que generan la biodiversidad y causan su pérdida son multiescalares, lo que representa un reto para el desarrollo de una base de evidencias para tener objetivos mundiales estandarizados. Ilustramos estos retos con el contraste del desarrollo de dos elementos clave del marco. El elemento de la diversidad genética en el objetivo 4 del marco está relacionado directamente con los objetivos principales del marco, pero su complejidad requiere el desarrollo de habilidades novedosas de participación. El objetivo para las áreas protegidas se comunicó con facilidad, pero estuvo relacionado de forma más indirecta con los resultados de biodiversidad; la evidencia de las ciencias sociales y ecológicas fue esencial para comunicar el contexto y las limitaciones de esta relación. Los científicos pueden fortalecer la efectividad de los acuerdos globales y abordar los retos que surgen de la complejidad, el escalamiento, las limitaciones en la capacidad y la interacción de la ciencia y los valores, si pueden priorizar la comunicación, la llegada a consensos y el conocimiento de redes y participan durante el proceso, a partir del desarrollo de una evidencia base hasta la implementación.

Incorporating citizen science into IUCN Red List assessments.

Many citizen scientists are highly motivated to help address the current extinction crisis. Their work is making valuable contributions to protecting species by raising awareness, identifying species occurrences, assessing population trends, and informing direct management actions, such as captive breeding. However, clear guidance is lacking about how to use existing citizen science data sets and how to design effective citizen science programs that directly inform extinction risk assessments and resulting conservation actions based on the International Union for Conservation of Nature (IUCN) Red List criteria. This may be because of a mismatch between what citizen science can deliver to address extinction risk and the reality of what is needed to inform threatened species listing based on IUCN criteria. To overcome this problem, we examined each IUCN Red List criterion (A-E) relative to the five major types of citizen science outputs relevant to IUCN assessments (occurrence data, presence-absence observations, structured surveys, physical samples, and narratives) to recommend which outputs are most suited to use when applying the IUCN extinction risk assessment process. We explored real-world examples of citizen science projects on amphibians and fungi that have delivered valuable data and knowledge for IUCN assessments. We found that although occurrence data are routinely used in the assessment process, simply adding more observations of occurrence from citizen science information may not be as valuable as inclusion of more nuanced data types, such as presence-absence data or information on threats from structured surveys. We then explored the characteristics of citizen science projects that have already delivered valuable data to support assessments. These projects were led by recognized experts who champion and validate citizen science data, thereby giving greater confidence in its accuracy. We urge increased recognition of the value of citizen science data within the assessment process.

Integración de la ciencia ciudadana a las evaluaciones de la Lista Roja de la UICN Resumen Existe mucha motivación entre los ciudadanos científicos para ayudar a enfrentar la actual crisis de extinción. Sus contribuciones son valiosas para la protección de las especies mediante la concientización, la detección de especies, la evaluación de las tendencias poblacionales y la información sobre acciones directas de gestión, como la cría en cautiverio. Sin embargo, faltan directrices claras sobre cómo utilizar los conjuntos de datos de ciencia ciudadana existentes y cómo diseñar programas de ciencia ciudadana eficaces que informen directamente las evaluaciones del riesgo de extinción y las acciones de conservación resultantes basadas en los criterios de la Lista Roja de la Unión Internacional para la Conservación de la Naturaleza (UICN). Esto puede deberse a un desajuste entre lo que la ciencia ciudadana puede aportar para abordar el riesgo de extinción y la realidad de lo que se necesita para fundamentar la inclusión de especies amenazadas en las listas según los criterios de la UICN. Para superar este obstáculo, analizamos cada criterio de la Lista Roja de la UICN (A­E) en relación a los cinco tipos principales de resultados de la ciencia ciudadana relevantes para las evaluaciones de la UICN (datos de presencia, observaciones de presencia­ausencia, encuestas estructuradas, muestras físicas y narraciones) para recomendar cuáles resultados son los más adecuados para la evaluación del riesgo de extinción de la UICN. Exploramos ejemplos reales de proyectos de ciencia ciudadana sobre anfibios y hongos que han aportado datos y conocimientos valiosos para las evaluaciones de la UICN. Descubrimos que, aunque los datos de presencia se utilizan de forma rutinaria en el proceso de evaluación, la adición de más observaciones de presencia a partir de información de ciencia ciudadana puede no ser tan valioso como la inclusión de tipos de datos más matizados, como datos de presencia­ausencia o información sobre amenazas a partir de encuestas estructuradas. Después analizamos las características de los proyectos de ciencia ciudadana que ya han aportado datos valiosos en apoyo de las evaluaciones. Estos proyectos fueron dirigidos por expertos reconocidos que defienden y validan los datos de la ciencia ciudadana, lo que da mayor confianza en su exactitud. Instamos a un mayor reconocimiento del valor de los datos de la ciencia ciudadana en el proceso de evaluación.

Exploring local perceptions and drivers of engagement in biodiversity monitoring among participants in payments for ecosystem services schemes in southeastern Mexico.

Payments for ecosystem services (PES) are widely applied incentive-based instruments with diverse objectives that increasingly include biodiversity conservation. Yet, there is a gap in understanding of how to best assess and monitor programs' biodiversity outcomes. We examined perceptions and drivers of engagement related to biodiversity monitoring through surveys among current PES participants in 7 communities in Mexico's Selva Lacandona. We conducted workshops among survey participants that included training and field deployment of tools used to monitor biodiversity and land cover, including visual transects, camera traps, acoustic recorders, and forest cover satellite images. We conducted pre- and postworkshop surveys in each community to evaluate changes in respondents' perceptions following exposure to biodiversity monitoring training and related field activities. We also reviewed existing research on participatory environmental management and monitoring approaches. One quarter of current PES participants in the study area participated in our surveys and workshops. The majority stated interest in engaging in diverse activities related to the procedural aspects of biodiversity monitoring (e.g., planning, field data collection, results dissemination) and acknowledged multiple benefits of introducing biodiversity monitoring into PES (e.g., knowledge and capacity building, improved natural resource management, and greater support for conservation). Household economic reliance on PES was positively associated with willingness to engage in monitoring. Technical expertise, time, and monetary constraints were deterrents. Respondents were most interested in monitoring mammals, birds, and plants and using visual transects, camera traps, and forest cover satellite images. Exposure to monitoring enhanced subsequent interest in monitoring by providing respondents with new insights from their communities related to deforestation and species' abundance and diversity. Respondents identified key strengths and weaknesses of applying different monitoring tools, which suggests that deploying multiple tools simultaneously can increase local engagement and produce complementary findings and data. Overall, our findings support the relevance and usefulness of incorporating participatory biodiversity monitoring into PES.

Explorando las percepciones locales y los impulsores de la participación en el monitoreo de la biodiversidad entre participantes de esquemas de pagos por servicios ambientales en el sureste de México Resumen Los pagos por servicios ambientales (PSA) son instrumentos basados en incentivos ampliamente aplicados cuyos diversos objetivos incluyen cada vez más la conservación de la biodiversidad. Sin embargo, existe una brecha en la comprensión de cómo evaluar y monitorear los resultados de los programas en materia de biodiversidad. Examinamos las percepciones y los impulsores de la participación relacionados al monitoreo de la biodiversidad a través de encuestas entre participantes actuales de PSA en siete comunidades de la Selva Lacandona de México. Realizamos talleres entre los participantes de las encuestas que incluyeron capacitación y despliegue en campo de herramientas utilizadas para monitorear la biodiversidad y la cobertura del suelo, incluidos transectos visuales, cámaras trampa, grabadores acústicos e imágenes satelitales de la cobertura forestal. Realizamos encuestas antes y después del taller en cada comunidad para evaluar los cambios en las percepciones de los participantes tras su involucramiento en la capacitación de monitoreo de biodiversidad y las actividades de campo relacionadas. También revisamos la investigación existente sobre enfoques de monitoreo y gestión ambiental participativa. Una cuarta parte de los participantes actuales de PES en el área de estudio participaron en nuestras encuestas y talleres. La mayoría declaró interés en participar en diversas actividades relacionadas con los aspectos procesales del monitoreo de la biodiversidad (por ejemplo, planificación, recopilación de datos de campo, difusión de resultados) y reconoció múltiples beneficios de introducir el monitoreo de la biodiversidad en los PSA (por ejemplo, creación de conocimientos y capacidades, mejora de la gestión de los recursos naturales, y mayor apoyo a la conservación). La dependencia económica de los hogares de los PSA se asoció positivamente con la voluntad de participar en el monitoreo. Los factores inhibidores fueron la experiencia técnica, el tiempo y las limitaciones monetarias. Los encuestados estaban más interesados en monitorear mamíferos, aves y plantas y en utilizar transectos visuales, cámaras trampa e imágenes satelitales de la cubierta forestal. La exposición al monitoreo aumentó el interés posterior en el monitoreo al brindar a los encuestados nuevos conocimientos de sus comunidades relacionados con la deforestación y la abundancia y diversidad de especies. Los encuestados identificaron fortalezas y debilidades clave al aplicar diferentes herramientas de monitoreo, lo que sugiere que implementar múltiples herramientas simultáneamente puede aumentar la participación local y producir hallazgos y datos complementarios. En general, nuestros hallazgos respaldan la relevancia y utilidad de incorporar el monitoreo participativo de la biodiversidad en los PSA.

Gut microbiome as a key monitoring indicator for reintroductions of captive animals.

Reintroduction programs seek to restore degraded populations and reverse biodiversity loss. To examine the hypothesis that gut symbionts could be used as an indicator of reintroduction success, we performed intensive metagenomic monitoring over 10 years to characterize the ecological succession and adaptive evolution of the gut symbionts of captive giant pandas reintroduced to the wild. We collected 63 fecal samples from 3 reintroduced individuals and 22 from 9 wild individuals and used 96 publicly available samples from another 3 captive individuals. By microbial composition analysis, we identified 3 community clusters of the gut microbiome (here termed enterotypes) with interenterotype succession that was closely related to the reintroduction process. Each of the 3 enterotypes was identified based on significant variation in the levels of 1 of 3 genera: Clostridium, Pseudomonas, and Escherichia. The enterotype of captive pandas was Escherichia. This enterotype was gradually replaced by the Clostridium enterotype during the wild-training process, which in turn was replaced by the Pseudomonas enterotype that resembled the enterotype of wild pandas, an indicator of conversion to wildness and a successful reintroduction. We also isolated 1 strain of Pseudomonas protegens from the wild enterotype, a previously reported free-living microbe, and found that its within-host evolution contributed to host dietary adaptation in the wild. Monitoring gut microbial structure provides a novel, noninvasive tool that can be used as an indicator of successful reintroduction of a captive individual to the wild.

Microbiomas intestinales como indicadores clave de monitoreo para la reintroducción de animales cautivos Resumen Los programas de reintroducción buscan restaurar las poblaciones degradadas y revertir la pérdida de la biodiversidad. Realizamos un monitoreo metagenómico intensivo durante más de diez años para caracterizar la sucesión ecológica y la evolución adaptativa de los simbiontes intestinales de pandas reintroducidos en la naturaleza y así comprobar la hipótesis de que estos simbiontes pueden usarse como indicadores de una reintroducción exitosa. Recolectamos 63 muestras fecales de tres individuos reintroducidos y 22 de nueve individuos silvestres y usamos 96 muestras disponibles al público de otros tres individuos cautivos. Mediante el análisis de la composición microbiana identificamos tres grupos comunitarios del microbioma intestinal (denominados como enterotipos) con una sucesión entre enterotipos relacionada cercanamente al proceso de reintroducción. Identificamos cada uno de los tres enterotipos con base en la variación significativa en los niveles de uno de los tres géneros: Clostridium, Pseudomonas, y Escherichia. El enterotipo de los pandas cautivos fue Escherichia. A este enterotipo lo reemplazó gradualmente el enterotipo de Clostridium durante el proceso de adaptación a la naturaleza, y a su vez fue reemplazado por el enterotipo de Pseudomonas similar al de los pandas silvestres, un indicador de la conversión a la vida silvestre y de una reintroducción exitosa. También aislamos una cepa de Pseudomonas protegens del enterotipo silvestre, un microbio reportado previamente como de vida libre, y descubrimos que su evolución dentro del hospedero contribuyó a que este se adaptara a la naturaleza de la dieta. El monitoreo de la estructura microbiana intestinal proporciona una herramienta novedosa y no invasiva que puede usarse como indicador del éxito de la reintroducción de un individuo cautivo a la naturaleza.

Influence of microclimate and forest management on bat species faced with global change.

Climate refugia, areas where climate is expected to remain relatively stable, can offer a near-term safe haven for species sensitive to warming temperatures and drought. Understanding the influence of temperature, moisture, and disturbance on sensitive species is critical during this time of rapid climate change. Coastal habitats can serve as important refugia. Many of these areas consist of working forestlands, and there is a growing recognition that conservation efforts worldwide must consider the habitat value of working lands, in addition to protected areas, to effectively manage large landscapes that support biodiversity. The sensitivity of forest bats to climate and habitat disturbance makes them a useful indicator taxon. We tested how microclimate and forest management influence habitat use for 13 species of insectivorous bats in a large climate refugium in a global biodiversity hotspot. We examined whether bat activity during the summer dry season is greater in forests where coastal fog provides moisture and more stable temperatures across both protected mature stands and those regularly logged. Acoustic monitoring was conducted at a landscape scale with 20 study sites, and generalized linear mixed models were used to examine the influence of habitat variables. Six species were positively associated with warmer nighttime temperature, and 5 species had a negative relationship with humidity or a positive relationship with climatic moisture deficit. Our results suggest that these mammals may have greater climate adaptive capacity than expected, and, for now, that habitat use may be more related to optimal foraging conditions than to avoidance of warming temperatures and drought. We also determined that 12 of the 13 regionally present bat species were regularly detected in commercial timberland stands. Because forest bats are highly mobile, forage over long distances, and frequently change roosts, the stewardship of working forests must be addressed to protect these species.

Influencia del microclima y el manejo forestal sobre especies de murciélagos ante el cambio global Resumen Los refugios climáticos, áreas en donde se espera que el clima permanezca relativamente estable, pueden ofrecer un santuario a corto plazo para las especies sensibles al aumento de temperaturas y la sequía. Es muy importante entender la influencia de la temperatura, la humedad y las perturbaciones sobre las especies sensibles durante estos tiempos de cambio climático repentino. Los hábitats costeros pueden funcionar como refugios importantes. Muchas de estas áreas consisten en bosques funcionales y cada vez hay más reconocimiento de que los esfuerzos mundiales de conservación deben considerar el valor del hábitat de los suelos funcionales, además de las áreas protegidas, para manejar de manera efectiva los extensos paisajes que mantienen a la biodiversidad. La sensibilidad de los murciélagos de los bosques ante las perturbaciones climáticas y de hábitat hace que sean un taxón indicador útil. Analizamos cómo los microclimas y el manejo forestal influyen sobre el uso de hábitat de 13 especies de murciélagos insectívoros en un refugio climático amplio dentro de un punto caliente de biodiversidad mundial. Examinamos si la actividad de los murciélagos durante la temporada seca de verano es mayor en los bosques en donde la niebla costera proporciona humedad y temperaturas más estables tanto en los árboles maduros como aquellos que son talados con regularidad. Realizamos el monitoreo acústico a escala de paisaje en 20 estudios de sitio y usamos modelos lineales mixtos generalizados para examinar la influencia de las variables del hábitat. Seis especies estuvieron asociadas positivamente con la temperatura nocturna más cálida y cinco especies tuvieron una relación negativa con la humedad o una relación positiva con el déficit climático de humedad. Nuestros resultados sugieren que estos mamíferos pueden tener una mayor capacidad de adaptación climática de lo que se pensaba y, por ahora, que el uso de hábitat puede estar más relacionado con las condiciones óptimas de forrajeo que con la evasión de las temperaturas elevadas y la sequía. También determinamos que 12 de las 13 especies con presencia regional fueron detectadas con regularidad en los puntos de tala comercial. Ya que los murciélagos del bosque tienden a moverse mucho, forrajear a lo largo de grandes distancias y con frecuencia cambiar de nido, debemos abordar la administración de los bosques funcionales para proteger a estas especies.

The potential influence of genome-wide adaptive divergence on conservation translocation outcome in an isolated greater sage-grouse population.

Conservation translocations are an important conservation tool commonly employed to augment declining or reestablish extirpated populations. One goal of augmentation is to increase genetic diversity and reduce the risk of inbreeding depression (i.e., genetic rescue). However, introducing individuals from significantly diverged populations risks disrupting coadapted traits and reducing local fitness (i.e., outbreeding depression). Genetic data are increasingly more accessible for wildlife species and can provide unique insight regarding the presence and retention of introduced genetic variation from augmentation as an indicator of effectiveness and adaptive similarity as an indicator of source and recipient population suitability. We used 2 genetic data sets to evaluate augmentation of isolated populations of greater sage-grouse (Centrocercus urophasianus) in the northwestern region of the species range (Washington, USA) and to retrospectively evaluate adaptive divergence among source and recipient populations. We developed 2 statistical models for microsatellite data to evaluate augmentation outcomes. We used one model to predict genetic diversity after augmentation and compared these predictions with observations of genetic change. We used the second model to quantify the amount of observed reproduction attributed to transplants (proof of population integration). We also characterized genome-wide adaptive divergence among source and recipient populations. Observed genetic diversity (HO = 0.65) was higher in the recipient population than predicted had no augmentation occurred (HO = 0.58) but less than what was predicted by our model (HO = 0.75). The amount of shared genetic variation between the 2 geographically isolated resident populations increased, which is evidence of periodic gene flow previously assumed to be rare. Among candidate adaptive genes associated with elevated fixation index (FST) (143 genes) or local environmental variables (97 and 157 genes for each genotype-environment association method, respectively), we found clusters of genes with related functions that may influence the ability of transplants to use local resources and navigate unfamiliar environments and their reproductive potential, all possible reasons for low genetic retention from augmentation.

Influencia potencial de la divergencia adaptativa a nivel genoma sobre el resultado de la reubicación para conservación en una población aislada de urogallo mayor Resumen Las reubicaciones para conservación son una herramienta importante que se usa con frecuencia para aumentar las poblaciones en declinación o reestablecer las poblaciones erradicadas. Una de las metas de este aumento es incrementar la diversidad genética y reducir el riesgo de depresión endogámica (es decir, rescate genético). Sin embargo, la introducción de individuos de una población con divergencia significativa puede perturbar los rasgos coadaptados y reducir la aptitud local (es decir, depresión exogámica). La información genética es cada vez más accesible para las especies silvestres y puede proporcionar conocimiento único con respecto a la presencia y retención de la variación genética introducida a partir del aumento como un indicador de eficiencia y las similitudes adaptativas como un indicador de la idoneidad de la población de origen y la receptora. Usamos dos conjuntos de datos genéticos para evaluar el aumento de las poblaciones aisladas del urogallo mayor (Centrocercus urophasianus) en la región noroeste de la distribución de la especie (Washington, EUA) y para evaluar de forma retrospectiva la divergencia adaptativa entre la población de origen y la receptora. Desarrollamos dos modelos estadísticos para los datos microsatelitales para así evaluar los resultados del aumento. Usamos un modelo para predecir la diversidad genética después del aumento y comparamos estas predicciones con observaciones del cambio genético. Usamos el segundo modelo para cuantificar el aumento de la reproducción observada atribuida a las reubicaciones (evidencia de la integración poblacional). También caracterizamos la divergencia adaptativa a nivel genoma entre la población de origen y la población receptora. La diversidad genética observada (HO = 0.65) fue mayor de lo que se predijo en la población receptora de no haber ocurrido el aumento (HO = 0.58) pero menor de lo que se predijo en nuestro modelo (HO = 0.75). El aumento de la variación genética compartida entre las dos poblaciones residentes geográficamente aisladas incrementó, lo cual es evidencia de un flujo génico periódico que antes se supuso casi no ocurría. Entre los genes adaptativos candidatos asociados a una FST elevada (143 genes) o a variables ambientales locales (97 y 157 genes para cada método de asociación entre el ambiente y el genotipo, respectivamente) encontramos grupos de genes con funciones relacionadas que pueden influir sobre la habilidad de cada reubicación para usar recursos locales y navegar ambientes desconocidos y su potencial reproductivo, todas posibles razones para la baja retención genética en el aumento.

An ecologically sound and participatory monitoring network for pan-Arctic seabirds.

In a warming Arctic, circumpolar long-term monitoring programs are key to advancing ecological knowledge and informing environmental policies. Calls for better involvement of Arctic peoples in all stages of the monitoring process are widespread, although such transformation of Arctic science is still in its infancy. Seabirds stand out as ecological sentinels of environmental changes, and priority has been given to implement the Circumpolar Seabird Monitoring Plan (CSMP). We assessed the representativeness of a pan-Arctic seabird monitoring network focused on the black-legged kittiwake (Rissa tridactyla) by comparing the distribution of environmental variables for all known versus monitored colonies. We found that with respect to its spatiotemporal coverage, this monitoring network does not fully embrace current and future environmental gradients. To improve the current scheme, we designed a method to identify colonies whose inclusion in the monitoring network will improve its ecological representativeness, limit logistical constraints, and improve involvement of Arctic peoples. We thereby highlight that inclusion of study sites in the Bering Sea, Siberia, western Russia, northern Norway, and southeastern Greenland could improve the current monitoring network and that their proximity to local populations might allow increased involvement of local communities. Our framework can be applied to improve existing monitoring networks in other ecoregions and sociological contexts.

Una red de monitoreo participativa y ecológica para las aves marinas del Ártico Resumen En un Ártico cada vez más cálido, los programas circumpolares de monitoreo a largo plazo son importantes para potenciar el conocimiento ecológico e informar las políticas ambientales. Existe un llamado generalizado para involucrar de mejor manera a los pueblos árticos en el proceso de monitoreo, aunque dicha transformación de la ciencia ártica todavía está en desarrollo. Las aves marinas resaltan como centinelas del cambio ambiental y se ha priorizado implementar el Plan Circumpolar de Monitoreo de Aves Marinas (CSMP). Comparamos la distribución de las variables ambientales de todas las colonias conocidas de la gaviota tridáctila (Rissa tridactyla) contra las colonias monitoreadas para evaluar la representación de una red pan­ártica de monitoreo enfocada en esta especie. Encontramos que esta red de monitoreo no considera del todo los gradientes ambientales actuales y futuros con respecto a la cobertura espaciotemporal. Para mejorar el esquema actual, diseñamos un método para identificar las colonias cuya inclusión en la red de monitoreo mejorará su representación ecológica, limitará las restricciones logísticas e incrementará la participación de los pueblos árticos. Por lo tanto, resaltamos que la inclusión de los sitios de estudio en el Mar de Bering, Siberia, Rusia occidental, el norte de Noruega y el sureste de Groenlandia mejorarían la red actual de monitoreo. También destacamos que la proximidad de los sitios de estudio con las poblaciones locales podría permitir una mayor participación de estas. Nuestro marco puede aplicarse para mejorar las redes de monitoreo existentes en otros contextos socioecológicos y ecoregiones.

Introducing Elinor for monitoring the governance and management of area-based conservation.

Monitoring the governance and management effectiveness of area-based conservation has long been recognized as an important foundation for achieving national and global biodiversity goals and enabling adaptive management. However, there are still many barriers that prevent conservation actors, including those affected by governance and management systems from implementing conservation activities and programs and from gathering and using data on governance and management to inform decision-making across spatial scales and through time. We explored current and past efforts to assess governance and management effectiveness and barriers actors face in using the resulting data and insights to inform conservation decision-making. To help overcome these barriers, we developed Elinor, a free and open-source monitoring tool that builds on the work of Nobel Prize winner Elinor Ostrom to facilitate the gathering, storing, sharing, analyzing, and use of data on environmental governance and management across spatial scales and for areas under different governance and management types. We consider the process of codesigning and piloting Elinor with conservation scientists and practitioners and the main components of the assessment and online data system. We also consider how Elinor complements existing approaches by addressing governance and management in a single assessment at a high level for different types of area-based conservation, providing flexible options for data collection, and integrating a data system with an assessment that can support data use and sharing across different spatial scales, including global monitoring of the Global Biodiversity Framework. Although challenges will continue, the process of developing Elinor and the tool itself offer tangible solutions to barriers that prevent the systematic collection and use of governance and management data. With broader uptake, Elinor can play a valuable role in enabling more effective, inclusive, and durable area-based conservation.

Introducción de Elinor para el monitoreo de la gobernanza y la gestión de la conservación con base en zonas geográficas Resumen El monitoreo de la efectividad de la gobernanza y de la gestión de la conservación basada en zonas geográficas ha sido reconocido durante mucho tiempo como una base importante para alcanzar las metas nacionales y mundiales de la biodiversidad y permitir un manejo adaptativo. Sin embargo, todavía existen barreras que evitan que los actores de la conservación, incluidos aquellos afectados por los sistemas de gobernanza y gestión, implementen actividades y programas de conservación y recopilen y usen datos de la gobernanza y la gestión para informar las decisiones a lo largo de las escalas espaciales y a través del tiempo. Exploramos los esfuerzos hechos en la actualidad y en el pasado para evaluar la efectividad de la gobernanza y la gestión así como las barreras que los actores enfrentan al usar los datos y el conocimiento resultantes para informar la toma de decisiones de conservación. Para ayudar a derribar estas barreras desarrollamos Elinor, una herramienta de monitoreo gratuita y de software libre que parte del trabajo de la ganadora del Premio Nobel Elinor Ostrom, para facilitar la recopilación, almacenamiento, divulgación, análisis y uso de los datos sobre la gobernanza y la gestión ambiental en las escalas espaciales y para las zonas con diferentes tipos de gobernanza y gestión. Planteamos co­diseñar y pilotear Elinor con los científicos y practicantes de la conservación y usando los componentes principales del sistema de evaluación y de datos en línea. También planteamos cómo Elinor complementa las estrategias existentes al abordar la gobernanza y la gestión en una sola evaluación a un nivel elevado para diferentes tipos de conservación basada en zonas geográficas, lo que proporciona opciones flexibles para la colecta de datos, e integramos un sistema de datos con una evaluación que soporta el uso y divulgación de datos en diferentes escalas espaciales, incluido el Marco Mundial para la Biodiversidad. Aunque los retos seguirán existiendo, el proceso de desarrollo de Elinor y la propia herramienta ofrecen soluciones tangibles a las barreras que previenen la colecta sistemática y el uso de datos de la gobernanza y la gestión. Con una mayor aceptación, Elinor puede tener un papel importante en el momento de hacer posible una conservación basada en zonas geográficas más eficaz, integradora y duradera.

Integrating adult occurrence and reproduction data to identify conservation measures for amphibians.

Monitoring programs are pivotal to establishing sound management. Due to economic, logistic, and time limitations, monitoring programs often overlook differences among life-history stages. However, species occurrence does not necessarily mean population viability, and it is unclear to what extent monitoring programs that do not consider separately adult presence and reproduction provide effective management indications. Unfortunately, collecting data on certain life stages requires high sampling effort, leading to a trade-off between model reliability and resources needed for monitoring. We collected data on presence and reproduction of amphibians by monitoring 207 waterbodies in Lombardy (northern Italy) in 2017-2022. We then used multistate occupancy models to test whether certain environmental features, namely, pond area, hydroperiod, forest cover, shade, aquatic vegetation, and predators' presence, differentially affected adult occurrence and breeding probabilities of multiple amphibian species. To assess optimal sampling efforts, we modeled the detection probabilities of adults and reproduction across multiple species. Finally, we identified the optimal monitoring strategy under different scenarios of resource availability, comparing adult-only monitoring versus joint assessment of the occurrence of adults and reproduction. In many cases, the main drivers of adult occurrence and reproduction did not coincide because most investigated ecological variables affected one life stage or the other. Forest area, for instance, increased occurrence probabilities of adults of the endemic Rana latastei but showed no effect on their reproduction probabilities. Quantitative estimates of the sampling effort showed that occurrence of adults was easier to spot in 4 out of 7 species. Multicriteria decision analyses showed that when resources were scarce, monitoring adults was the optimal strategy for those 4 species. Conversely, with more resources, monitoring both adults and reproduction emerged as the best strategy for all the considered species. Integrated monitoring of adults and reproduction is essential to comprehensively identify effective conservation measures for amphibians.

Integración de datos de presencia adulta y de reproducción para identificar medidas de conservación para los anfibios Resumen Los programas de monitoreo son fundamentales para establecer una gestión adecuada. Debido a limitaciones económicas, logísticas y de tiempo, los programas de seguimiento suelen pasar por alto las diferencias entre las distintas fases del ciclo de vida. Sin embargo, la presencia de especies no significa necesariamente la viabilidad de la población, y no está claro hasta qué punto los programas de seguimiento que no consideran por separado la presencia de adultos y la reproducción proporcionan indicaciones eficaces para la gestión. Desgraciadamente, la recolección de datos sobre etapas determinadas del ciclo de vida requiere un gran esfuerzo de muestreo, lo que lleva a un compromiso entre la fiabilidad del modelo y los recursos necesarios para el seguimiento. Recopilamos datos sobre la presencia y reproducción de anfibios mediante el monitoreo de 207 cuerpos de agua en Lombardía (norte de Italia) entre 2017 y 2022. Después utilizamos modelos de ocupación multiestado para comprobar si determinadas características ambientales (superficie de los estanques, hidroperiodo, cubierta forestal, sombra, vegetación acuática y presencia de depredadores) afectaban de forma diferencial la presencia de adultos y a las probabilidades de reproducción de múltiples especies de anfibios. Para evaluar los esfuerzos de muestreo óptimos, modelamos las probabilidades de detección de adultos y reproducción de múltiples especies. Por último, identificamos la estrategia de seguimiento óptima en diferentes escenarios de disponibilidad de recursos y comparamos el seguimiento exclusivo de adultos frente a la evaluación conjunta de la presencia de adultos y reproducción. En muchos casos, los principales factores en la presencia de adultos y en la reproducción no coincidían, ya que la mayoría de las variables ecológicas investigadas afectaban a una u otra etapa del ciclo. La cubierta forestal, por ejemplo, aumentó la probabilidad de presencia de adultos de la especie endémica Rana latastei pero no mostraron un efecto sobre su probabilidad de reproducción. Las estimaciones cuantitativas del esfuerzo de muestreo mostraron que la presencia de adultos era más fácil de detectar en cuatro de las siete especies. Los análisis de decisión multicriterio mostraron que, cuando los recursos eran escasos, el seguimiento de los adultos era la estrategia óptima para esas cuatro especies. Por el contrario, con más recursos, el seguimiento tanto de los adultos como de la reproducción resultó ser la mejor estrategia para todas las especies consideradas. El seguimiento integrado de los adultos y la reproducción es esencial para identificar de forma exhaustiva medidas de conservación eficaces para los anfibios.

Understanding variation in impacts from private protected areas across regions and protection mechanisms to inform organizational practices.

Private land protection is an important and growing tool to address biodiversity loss and climate change. Thus, better empirical evidence on the effectiveness of private land protection and organizational practices, such as targeting of lands for protection and choice of protection mechanism (i.e., fee simple land acquisition and conservation easements), is needed. We addressed this gap by estimating the impacts of The Nature Conservancy's (TNC) (a large nongovernmental organization with relatively decentralized management) conservation land acquisitions and easements from 1988 to 2016 in three regions of the United States (Mid-Atlantic, New England and New York, and California). We estimated impact in terms of avoided conversion by comparing natural land cover on 3179 protected parcels with matched unprotected parcels. Nineteen of 21 ecoregional plans used threats of agriculture and development to identify priorities for protection. When regions and protection mechanisms were pooled, on average there was no evidence of avoided conversion from 1988 to 2016. Accounting for mechanisms, TNC land acquisitions avoided conversion and easements did not. TNC's easements on parcels acquired by conservation partners did avoid conversion. Limitations of these results include focus on a single measure of impact, inability to capture future avoided conversion, and low land cover change accuracy in California. Our results suggest that private land protection managers who seek to avoid land conversion in the near to medium term should increase focus on areas with higher threats. Special attention should be paid to strengthening accountability and the role of partners, improving or clarifying how easements are used, and facilitating the flow of resources to work with the greatest potential impact.

Comprensión de la variación en el impacto de las áreas protegidas privadas sobre las regiones y los mecanismos de protección para guiar las prácticas organizativas Resumen La protección de terreno privado es una herramienta importante, aunque su naturaleza voluntaria puede sesgar la protección hacia parcelas menos amenazadas­lo que resulta en que la conversión no se evite o se evite muy poco. Además, muchos programas de protección privada tienen una supervisión limitada y pocos reportes de sus resultados. Por lo tanto, se necesitan mejores evidencias empíricas de la efectividad de la protección en suelo privado y las prácticas organizativas, como el enfoque en tierras para protección y la selección de los mecanismos de protección (adquisición de terrenos a título oneroso y servidumbres de conservación). Abordamos esta brecha con la estimación de impactos de las adquisiciones de suelo de The Nature Conservancy (TNC, una gran organización no gubernamental con un manejo relativamente descentralizado) y las servidumbres implementadas entre 1988 y 2016 en tres regiones de los Estados Unidos: Atlántico Medio, Nueva Inglaterra y Nueva York, y California. Estimamos el impacto en términos de la conversión que se evitó al comparar la cobertura de suelo en 3,179 parcelas protegidas con parcelas desprotegidas equivalentes. Diecinueve de los 21 planes eco­regionales usaron las amenazas a la agricultura y al desarrollo para identificar las prioridades de protección. Cuando agrupamos las regiones y los mecanismos de protección, en promedio no hubo impacto alguno. Si se consideran los mecanismos, las adquisiciones de suelo de la TNC tuvieron un impacto mientras que las servidumbres no. Las servidumbres de la TNC en las parcelas adquiridas por socios de conservación sí tuvieron un impacto, aunque esta manera de proteger sólo se presentó en las regiones del Atlántico Medio y de Nueva Inglaterra y Nueva York. Nuestros resultados sugieren que la protección privada, especialmente mediante servidumbres, puede estar sesgada hacia suelos no amenazados. Los gestores que buscan evitar la conversión del suelo a mediano o corto plazo deberían enfocarse más en las áreas con más amenazas. Se debería prestar especial atención al fortalecimiento del papel y las responsabilidades de los socios, a la mejora o aclaración de cómo se usan las servidumbres y la facilitación del flujo de recursos para trabajar con el mayor impacto potencial.

Infliximab serum concentrations in luminal Crohn's disease and its relationship with disease activity: A multicentric cross-sectional study.

OBJECTIVES: In Latin America, experience with monitoring serum Infliximab (IFX) concentrations is scarce. Our study aimed to compare IFX serum concentrations between patients with active disease or in remission. PATIENTS AND METHODS: A cross-sectional study was performed in patients with luminal Crohn's disease (CD) during maintenance treatment with IFX. Patients were classified as in remission or disease activity according to clinical scores and endoscopic, radiological, and laboratory markers. A comparison of IFX trough levels between the two groups was performed. RESULTS: 80 CD patients were included [41 (51%) in remission and 39 (49%) with active disease]. In the analysis of general disease activity, the median serum levels of IFX in patients with remission and with active CD were 5.63 [0.03-14.40] vs. 3.84 [0.03-14.40] (p=0.287). Furthermore, there was no difference in serum IFX concentrations in endoscopic, radiological, and laboratory activities. Only in the clinical evaluation there was a significant difference in the median serum IFX levels between patients in remission and disease activity, 5.63 [0.03-14.40] vs. 2.14 [0.32-10.54] (p=0.042). CONCLUSIONS: IFX serum concentrations during maintenance treatment were similar in patients with luminal CD in remission and general, endoscopic, radiological, and laboratory disease activity. Patients with clinically active disease had lower IFX concentrations than patients in remission.

Achieving a real-time online monitoring system for conservation culturomics.

Environmental monitoring is increasingly shifting toward a set of systems that describe changes in real time. In ecology specifically, a series of challenges have prevented the rollout of real-time monitoring for features such as biodiversity change or ecosystem service provision. Conservation culturomics, a field concerned with interactions between people and nature, is well placed to demonstrate how monitoring might move toward a network of real-time platforms, given its existence exclusively in the digital realm. We examined a set of considerations associated with the development of real-time monitoring platforms for conservation culturomics and introduce a near real-time platform for the Species Awareness Index, a global index of changing biodiversity awareness derived from the rate of change in page views for species on Wikipedia. This platform will update automatically each month, operating in near real time (https://joemillard.shinyapps.io/Real_time_SAI/). There are plans to make the underlying data queryable via an application programing interface independent of the platform. The real-time Species Awareness Index will represent the first real-time and entirely automated conservation culturomic platform and one of the first real-time platforms in the discipline of ecology. Real-time monitoring for culturomics can provide insight into human-nature interactions as they play out in the physical realm and provide a framework for the development of real-time monitoring in ecology. Real-time monitoring metrics can be processed on private virtual machines and hosted on publicly available cloud services. Conservation now needs an online, real-time observatory that can evolve with the structure of the web.

Obtención de un sistema virtual de monitoreo en tiempo real para la culturomía de la conservación Resumen El monitoreo ambiental se enfoca cada vez más en un conjunto de sistemas que describen los cambios en tiempo real. En cuanto a la ecología, una serie de obstáculos ha impedido el despliegue del monitoreo en tiempo real para funciones como el cambio en la biodiversidad o el suministro de servicios ambientales. La culturomía de la conservación, un campo enfocado en las interacciones entre las personas y la naturaleza, es una buena opción para demostrar cómo el monitoreo podría transformarse en una red de plataformas en tiempo real, dado que sólo existe en el ámbito digital. Analizamos una serie de consideraciones asociadas con el desarrollo de plataformas de monitoreo en tiempo real para la culturomía de la conservación e introdujimos una plataforma casi en tiempo real para el Índice de Conciencia de Especies, un índice mundial del cambio en la conciencia sobre la biodiversidad derivado de la tasa de cambio en las visitas a las páginas de Wikipedia de diferentes especies. Esta plataforma se actualizará automáticamente cada mes, por lo que opera casi en tiempo real (https://joemillard.shinyapps.io/Real_time_SAI/). Existen planes para hacer que los datos subyacentes sean consultables por medio de una interfaz de programación de aplicaciones independiente de la plataforma. El Índice de Conciencia de Especies en tiempo real será la primera plataforma de culturomía de la conservación automatizada por completo y en tiempo real, así como una de las primeras plataformas de este tipo para la disciplina de la ecología. El monitoreo en tiempo real de la culturomía puede proporcionar información sobre las interacciones humano-naturaleza conforme se desarrollan en el ámbito físico y también un marco de trabajo para el desarrollo del monitoreo en tiempo real para la ecología. Las medidas del monitoreo en tiempo real pueden procesarse en máquinas virtuales privadas y albergarse en servicios públicos de nubes de almacenamiento. Hoy en día, la conservación necesita un observatorio en línea y en tiempo real que pueda evolucionar con la estructura de la web.

Influence of interactive effects on long-term population trajectories in multispecies reintroductions.

Reintroduced populations are typically considered to progress through establishment, growth, and regulatory phases. However, most reintroduction programs do not monitor intensively enough to test this conceptual model. We studied population indices derived from track activity of 4 threatened species (greater bilby [Macrotis lagotis], burrowing bettong [Bettongia lesueur], greater stick-nest rat [Leporillus conditor], and Shark Bay bandicoot [Perameles bougainville]) over 23 years after multiple reintroductions of each species in arid Australia. We compared population trajectories among species and investigated the effect of time and environmental variables. All species bred immediately after release, and the growth phase lasted 3-16 years, varying markedly among but not within species. The end of the growth phase was characterized by an obvious peak in population density followed by either a catastrophic decline and sustained low density (bettongs), a slow decline to extirpation after 20 years (stick-nest rat), or a slight decline followed by irregular fluctuations (bilby and bandicoot). Minor fluctuations were related to environmental variables, including 12-month cumulative rainfall and lagged summer maximum temperatures. Three of the 4 species did not reach a regulation phase, even after 23 years, possibly due to interspecific competition and trophic cascades triggered by predator removal and multispecies reintroductions. Bilbies and bandicoots exhibited a second growth phase 18 years after reintroduction, likely caused by high rainfall and increased resources following the population crash of overabundant bettongs. Our results suggest that assemblages within multispecies reintroductions demonstrate high variability in population trajectories due to interactive effects. Intensive monitoring to assess population viability may require decades, particularly where multiple species are reintroduced, release sites are confined, and the climate is unpredictable. Intensive monitoring also allows for adaptive management to prevent precipitous population declines. Practitioners should not assume reintroduced species pass through predictable postrelease population phases or that viability is assured after a certain period.

Influencia de los efectos interactivos sobre la trayectoria a largo plazo de las poblaciones en reintroducciones de múltiples especies Resumen Comúnmente se considera que las poblaciones reintroducidas progresan cuando se establecen, crecen y atraviesan fases regulatorias. Sin embargo, casi todos los programas de reintroducción no monitorean lo suficiente para evaluar este modelo conceptual. Estudiamos los índices poblacionales derivados de la actividad de rastreo de cuatro especies amenazadas (Macrotis lagotis, Bettongia lesueur, Leporillus conditor, y Perameles bougainville) más de 23 años después de varias reintroducciones de cada especie en las zonas áridas de Australia. Comparamos las trayectorias poblacionales entre especies e investigamos el efecto del tiempo y las variables ambientales. Todas las especies se reprodujeron inmediatamente después de la liberación, y la fase de crecimiento duró entre 3 y 16 años, con una variación marcada entre, pero no dentro de las especies. El final de la fase de crecimiento se caracterizó por un pico obvio en la densidad poblacional seguido de una declinación catastrófica o una baja densidad sostenida (B. lesueur), una declinación lenta ante la extirpación 20 años después (L. conditor) o una declinación leve seguida de fluctuaciones irregulares (M. lagotis y P. bougainville). Las fluctuaciones menores estuvieron relacionadas con las variables ambientales, incluyendo la precipitación acumulada de 12 meses y el retraso en las temperaturas máximas de verano. Tres de las cuatro especies no llegaron a la fase regulatoria, incluso después de 23 años, posiblemente por la competencia interespecífica y las cascadas tróficas causadas por la eliminación de depredadores y la reintroducción de varias especies. M. lagotis y P. bougainville exhibieron una segunda fase de crecimiento 18 años después de la reintroducción, probablemente causada por la precipitación elevada y el incremento de recursos después de la crisis poblacional por sobreabundancia de B. lesueur. Nuestros resultados sugieren que los conjuntos dentro de la reintroducción de múltiples especies demuestran una gran variabilidad en las trayectorias poblacionales debido a los efectos interactivos. El monitoreo intenso para evaluar la viabilidad poblacional puede llevar varias décadas, particularmente cuando se reintroducen varias especies, en donde los sitios de liberación están confinados y en donde el clima es impredecible. El monitoreo intensivo también permite que el manejo adaptativo prevenga una declinación poblacional precipitada. Quienes practican la conservación no deberían asumir que una especie reintroducida atraviesa fases predecibles después de la liberación o que la viabilidad está asegurada después de cierto periodo.

Evaluating pollution-related damage and restoration success in urban forests with participatory monitoring and digital tools.

Peri-urban forest monitoring requires indicators of vegetation damage. An example is the sacred fir (Abies religiosa) forests surrounding Mexico City, which have been heavily exposed to tropospheric ozone, a harmful pollutant, for over 4 decades. We developed a participatory monitoring system with which local community members and scientists generated data on ozone tree damage. Santa Rosa Xochiac rangers (13) used the digital tool KoboToolBox to record ozone damage to trees, tree height, tree ages, tree condition, tree position, and whether the tree had been planted. Thirty-five percent of the trees (n = 1765) had ozone damage. Younger trees had a lower percentage of foliage damaged by ozone than older trees (p < 0.0001), and asymptomatic trees tended to be younger (p < 0.0001). Symptomatic trees were taller than asymptomatic trees of the same age (R2 c  = 0.43, R2 m  = 0.27). Involving local communities facilitated forest monitoring and using digital technology improved data quality. This participatory system can be used to monitor forest condition change over time and thus aids restoration efforts driven by government or local communities' interests, facilitating local decision-making.

Evaluación del daño relacionado a la contaminación y del éxito de la restauración de los bosques urbanos con un monitoreo participativo y herramientas digitales Resumen El monitoreo de los bosques periurbanos requiere indicadores de daños en la vegetación. Un ejemplo son los bosques de abeto (Abies religiosa) que rodean la Ciudad de México, pues desde hace más de 4 décadas han estado expuestos al ozono troposférico, un contaminante nocivo. Desarrollamos un sistema de monitoreo participativo con el que miembros de la comunidad local y científicos generaron datos sobre los daños causados por el ozono en los árboles. Los guardabosques de Santa Rosa Xochiac (133) utilizaron la herramienta digital KoboToolBox para registrar los daños causados por el ozono en los árboles, su altura, edad, estado, posición y si eran árboles plantados. El 35% de los árboles (n = 1,765) presentó daños por ozono. Los árboles más jóvenes tenían un menor porcentaje de follaje dañado por el ozono que los árboles más viejos (p<0.0001), y los árboles asintomáticos tendían a ser más jóvenes (p<0.0001). Los árboles sintomáticos eran más altos que los asintomáticos de la misma edad (R2 c = 0.43, R2 m = 0.27). La participación de las comunidades locales facilitó el monitoreo forestal y el uso de tecnología digital mejoró la calidad de los datos. Este sistema participativo puede utilizarse para monitorear los cambios en el estado de los bosques a lo largo del tiempo y contribuir a los esfuerzos de restauración impulsados por el gobierno o las comunidades locales, facilitando la toma de decisiones a nivel local.

A multidisciplinary approach to estimating wolf population size for long-term conservation.

The wolf (Canis lupus) is among the most controversial of wildlife species. Abundance estimates are required to inform public debate and policy decisions, but obtaining them at biologically relevant scales is challenging. We developed a system for comprehensive population estimation across the Italian alpine region (100,000 km2 ), involving 1513 trained operators representing 160 institutions. This extensive network allowed for coordinated genetic sample collection and landscape-level spatial capture-recapture analyses that transcended administrative boundaries to produce the first estimates of key parameters for wolf population status assessment. Wolf abundance was estimated at 952 individuals (95% credible interval 816-1120) and 135 reproductive units (i.e., packs) (95% credible interval 112-165). We also estimated that mature individuals accounted for 33-45% of the entire population. The monitoring effort was spatially estimated thereby overcoming an important limitation of citizen science data. This is an important approach for promoting wolf-human coexistence based on wolf abundance monitoring and an endorsement of large-scale harmonized conservation practices.

Una estrategia multidisciplinaria para la estimación del tamaño poblacional de los lobos para la conservación a largo plazo Resumen El lobo (Canis lupus) está entre las especies de fauna más controversiales. Se requieren estimaciones de abundancia para informar al debate público y las decisiones políticas, pero es un reto obtenerlos en escalas con relevancia biológica. Desarrollamos un sistema para la estimación completa de la población en la región alpina de Italia (100,000 km2 ), con la participación de 1,513 operadores entrenados que representan a 160 instituciones. Esta red extensa permitió una colecta coordinada de muestras genéticas y análisis de captura-recaptura espacial que trascendieron las fronteras administrativas para así producir las primeras estimaciones de los parámetros clave para la evaluación del estado de la población de los lobos. Se estimó la abundancia en 952 individuos (95% intervalo de confianza 816-1120) y 135 unidades reproductivas (es decir, manadas) (95% intervalo de confianza 112-165). También estimamos que los individuos maduros representaban el 33-45% de toda la población. El esfuerzo de monitoreo se estimó espacialmente, por lo que sobrepasó una limitación importante de la ciencia ciudadana. Esta estrategia es importante para promover la coexistencia entre lobos y humanos con base en el monitoreo de la abundancia y el apoyo a las prácticas armonizadas de conservación a gran escala.

Four challenges to an effective national nature assessment.

Comprehensive biodiversity assessments play an essential role in strengthening global and national conservation strategies. The recently announced first U.S. National Nature Assessment (NNA) provides an unparalleled opportunity to comprehensively review status and trends of biodiversity at all levels. This broad context can help in the coordination of actions to conserve individual species and ecosystems. The scientific assessments that informed the Kunming-Montreal Global Biodiversity Framework adopted at the 2022 Convention on Biological Diversity (CBD) conference of parties provide models for synthesizing information on trends at multiple levels of biodiversity, including decline in abundance and distribution of species, loss of populations and genetic diversity, and degradation and loss of ecosystems and their services. The assessments then relate these trends to data on drivers of biodiversity loss and pathways to their mitigation. The U.S. NNA can augment such global analyses and avoid the pitfalls encountered by previous U.S. efforts by ensuring policy-relevant design, data accessibility, and inclusivity in process and product and by incorporating spatial data relevant to national and subnational audiences. Although the United States is not formally a CBD party, an effective NNA should take full advantage of the global context by including indicators adopted at the 2022 meeting and incorporating an independent review mechanism that supports periodic stocktaking and ratcheting up of ambition in response to identified shortfalls in stemming biodiversity loss. The challenges to design of an effective U.S. assessment are relevant globally as nations develop assessments and reporting to support the new global biodiversity framework's targets. By considering and incorporating the diverse ways in which society values and benefits from nature, such assessments can help bridge the gap between research and conservation practice and communicate the extent of the biodiversity crisis to the public, fostering broad-based support for transformative change in humanity's relationship to the natural world.

Cuatro obstáculos para una eficaz evaluación nacional de la naturaleza Resumen Las evaluaciones completas de la biodiversidad tienen un papel esencial en el fortalecimiento de las estrategias de conservación nacional y mundial. La recién anunciada Evaluación Nacional de la Naturaleza (ENN) de los EE. UU. proporciona una oportunidad sin precedentes para revisar de manera completa el estado y las tendencias de la biodiversidad en todos los niveles. Este contexto generalizado puede ayudar a la coordinación de acciones para la conservación de especies individuales y ecosistemas. Las evaluaciones científicas que guiaron el Marco Mundial de la Biodiversidad de Kumming-Montreal adoptado en la conferencia de las partes de la Convención sobre la Diversidad Biológica (CBD) de 2022 proporcionan modelos para sintetizar la información sobre las tendencias de la biodiversidad a varios niveles, incluyendo la declinación en abundancia y distribución de especies, pérdida de poblaciones y diversidad genética y la degradación y pérdida de los ecosistemas y sus servicios. Después de esto, las evaluaciones relacionan estas tendencias con la información sobre los causantes de la pérdida de la biodiversidad y las maneras de mitigarla. La ENN de los EE. UU. pueden aumentar estos análisis mundiales y evitar las dificultades enfrentadas por los esfuerzos previos al garantizar un diseño relevante para las políticas, la disponibilidad de datos y la inclusión en el proceso y el producto y también mediante la incorporación de datos espaciales relevantes para el público nacional y subnacional. Aunque los EE. UU. no son una parte formal de la CBD, una ENN efectiva debería aprovechar de lleno el contexto global al incluir los indicadores adoptados en la reunión de 2022 e incorporar un mecanismo independiente de revisión que respalde el balance periódico y el aumento de la ambición en respuesta a las deficiencias detectadas en la contención de la pérdida de biodiversidad. Los retos para diseñar una evaluación estadunidense son relevantes a nivel mundial ya que los países evalúan y reportan para mantener los objetivos mundiales de biodiversidad post-2020. Si consideramos las diferentes maneras en las que la sociedad valora y se beneficia de la naturaleza, dichas evaluaciones pueden ayudar a cerrar la brecha entre la investigación y la práctica de la conservación y a comunicarle al público el nivel de la crisis de la biodiversidad, lo que fomenta el apoyo generalizado para transformar la relación entre la humanidad y el mundo natural.

Implications of the scale of detection for inferring co-occurrence patterns from paired camera traps and acoustic recorders.

Multifunctional landscapes that support economic activities and conservation of biological diversity (e.g., cattle ranches with native forest) are becoming increasingly important because small remnants of native forest may comprise the only habitat left for some wildlife species. Understanding the co-occurrence between wildlife and disturbance factors, such as poaching activity and domesticated ungulates, is key to successful management of multifunctional landscapes. Tools to measure co-occurrence between wildlife and disturbance factors include camera traps and autonomous acoustic recording units. We paired 52 camera-trap stations with acoustic recorders to investigate the association between 2 measures of disturbance (poaching and cattle) and wild ungulates present in multifunctional landscapes of the Colombian Orinoquía. We used joint species distribution models to investigate species-habitat associations and species-disturbance correlations. One model was fitted using camera-trap data to detect wild ungulates and disturbance factors, and a second model was fitted after replacing camera-trap detections of disturbance factors with their corresponding acoustic detections. The direction, significance, and precision of the effect of covariates depended on the sampling method used for disturbance factors. Acoustic monitoring typically resulted in more precise estimates of the effects of covariates and of species-disturbance correlations. Association patterns between wildlife and disturbance factors were found only when disturbance was detected by acoustic recorders. Camera traps allowed us to detect nonvocalizing species, whereas audio recording devices increased detection of disturbance factors leading to more precise estimates of co-occurrence patterns. The collared peccary (Pecari tajacu), lowland tapir (Tapirus terrestris), and white-tailed deer (Odocoileus virginianus) co-occurred with disturbance factors and are conservation priorities due to the greater risk of poaching or disease transmission from cattle.

Implicaciones de la escala de detección para inferir los patrones de coocurrencia a partir de fototrampas y grabaciones emparejadas Resumen Los paisajes multifuncionales que sostienen actividades económicas y la conservación de la biodiversidad (p. ej., ganadería en bosques nativos) son cada vez más importantes porque los pequeños reductos de bosque nativo podrían comprender el único hábitat disponible para algunas especies de fauna. Es importante entender la coocurrencia entre la fauna y los factores de perturbación, como la actividad furtiva y los ungulados domésticos, para tener un manejo exitoso de los paisajes multifuncionales. Las herramientas que miden esta relación incluyen las fototrampas y las unidades autónomas de grabaciones acústicas. Emparejamos 52 estaciones de fototrampas con grabadoras acústicas para investigar la asociación entre dos medidas de perturbación (actividad furtiva y ganado) y los ungulados silvestres presentes en los paisajes multifuncionales de la Orinoquía colombiana. Usamos modelos conjuntos de distribución de especies para investigar las asociaciones especie-hábitat y las correlaciones especie-perturbación. Ajustamos un modelo con datos de fototrampeo para detectar ungulados silvestres y factores de perturbación; un segundo modelo fue ajustado después de reemplazar las detecciones por fototrampas de los factores de perturbación con las detecciones acústicas correspondientes. La dirección, importancia y precisión del efecto de las covarianzas dependió del método de muestreo usado para los factores de perturbación. El monitoreo acústico casi siempre resultó en estimaciones más precisas de los efectos de las covarianzas y de las correlaciones especie-perturbación. Los patrones de asociación entre la fauna y los factores de perturbación sólo se presentaron cuando las grabadoras acústicas detectaron la perturbación. Las fototrampas nos permitieron detectar especies que no vocalizan, mientras que las grabaciones de audio incrementaron la detección de factores de perturbación, lo que resultó en estimados más precisos de los patrones de coocurrencia. El pecarí de collar (Pecari tajacu), el tapir (Tapirus terrestris) y el venado cola blanca (Odocoileus virginianus) tuvieron coocurrencia con los factores de perturbación y tienen prioridad de conservación debido al mayor riesgo de caza furtiva o transmisión de enfermedades del ganado.