Shotgun isotope array for rapid, substrate-specific detection of microorganisms in a microbial community.

Tobino, Tomohiro; Kurisu, Futoshi; Kasuga, Ikuro; Furumai, Hiroaki

Tobino, Tomohiro; Kurisu, Futoshi; Kasuga, Ikuro; Furumai, Hiroaki.

Afiliação

Tobino T; Department of Urban Engineering, Graduate School of Engineering, The University of Tokyo, 7-3-1 Hongo, Bunkyo-ku, Tokyo 113-8656, Japan. tobino@env.t.u-tokyo.ac.jp

Appl Environ Microbiol ; 77(20): 7430-2, 2011 Oct.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-21873478

RESUMO

The shotgun isotope array method has been proposed to be an effective new tool for use in substrate-specific microbe exploration without any prior knowledge of the community composition. Proof of concept was demonstrated by detection of acetate-degrading microorganisms in activated sludge and further verified by independent stable isotope probing (SIP).

Assuntos

Bactérias/classificação; Bactérias/isolamento & purificação; Técnicas Bacteriológicas/métodos; Isótopos/metabolismo; Coloração e Rotulagem/métodos; Bactérias/genética; Bactérias/metabolismo; DNA Bacteriano/química; DNA Bacteriano/genética; DNA de Protozoário/química; DNA de Protozoário/genética; DNA Ribossômico/química; DNA Ribossômico/genética; Dados de Sequência Molecular; Plasmodium/genética; Plasmodium/isolamento & purificação; RNA Ribossômico 16S/genética; Análise de Sequência de DNA; Esgotos/microbiologia

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Coloração e Rotulagem / Bactérias / Técnicas Bacteriológicas / Isótopos Tipo de estudo: Diagnostic_studies Idioma: En Ano de publicação: 2011 Tipo de documento: Article

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