A new method for stranded whole transcriptome RNA-seq.

Miller, David F B; Yan, Pearlly S; Buechlein, Aaron; Rodriguez, Benjamin A; Yilmaz, Ayse S; Goel, Shokhi; Lin, Hai; Collins-Burow, Bridgette; Rhodes, Lyndsay V; Braun, Chris; Pradeep, Sunila; Rupaimoole, Rajesha; Dalkilic, Mehmet; Sood, Anil K; Burow, Matthew E; Tang, Haixu; Huang, Tim H; Liu, Yunlong; Rusch, Douglas B; Nephew, Kenneth P

Miller, David F B; Yan, Pearlly S; Buechlein, Aaron; Rodriguez, Benjamin A; Yilmaz, Ayse S; Goel, Shokhi; Lin, Hai; Collins-Burow, Bridgette; Rhodes, Lyndsay V; Braun, Chris; Pradeep, Sunila; Rupaimoole, Rajesha; Dalkilic, Mehmet; Sood, Anil K; Burow, Matthew E; Tang, Haixu; Huang, Tim H; Liu, Yunlong; Rusch, Douglas B; Nephew, Kenneth P.

Afiliação

Miller DF; Medical Sciences, Indiana University School of Medicine, 1001 East 3rd St., Bloomington, IN 47405, United States. Electronic address: millerdf@indiana.edu.

Methods ; 63(2): 126-34, 2013 Sep 15.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-23557989

Assuntos

Perfilação da Expressão Gênica/métodos; RNA Mensageiro/genética; Análise de Sequência de RNA; Linhagem Celular Tumoral; Biblioteca Gênica; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala; Humanos; Anotação de Sequência Molecular; Polimorfismo de Nucleotídeo Único; Isoformas de Proteínas/genética; Isoformas de Proteínas/metabolismo; RNA Mensageiro/isolamento & purificação; RNA Mensageiro/metabolismo; RNA Ribossômico/química; RNA Ribossômico/isolamento & purificação; Reação em Cadeia da Polimerase em Tempo Real; Reação em Cadeia da Polimerase Via Transcriptase Reversa; Ribonucleases/química

Palavras-chave

DSN; Duplex-specific nuclease; FLgRNA; Gene expression; LgRNA; RNA-seq; Transcriptome; duplex-specific nuclease; fragmented LgRNA; large total RNA >200 nt; smRNA; small total RNA <200 nt

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: RNA Mensageiro / Análise de Sequência de RNA / Perfilação da Expressão Gênica Limite: Humans Idioma: En Ano de publicação: 2013 Tipo de documento: Article

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