Extending RosettaDock with water, sugar, and pH for prediction of complex structures and affinities for CAPRI rounds 20-27.

Kilambi, Krishna Praneeth; Pacella, Michael S; Xu, Jianqing; Labonte, Jason W; Porter, Justin R; Muthu, Pravin; Drew, Kevin; Kuroda, Daisuke; Schueler-Furman, Ora; Bonneau, Richard; Gray, Jeffrey J

Kilambi, Krishna Praneeth; Pacella, Michael S; Xu, Jianqing; Labonte, Jason W; Porter, Justin R; Muthu, Pravin; Drew, Kevin; Kuroda, Daisuke; Schueler-Furman, Ora; Bonneau, Richard; Gray, Jeffrey J.

Afiliação

Kilambi KP; Department of Chemical and Biomolecular Engineering, Johns Hopkins University, Baltimore, Maryland.

Proteins ; 81(12): 2201-9, 2013 Dec.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-24123494

Assuntos

Carboidratos/química; Colicinas/química; Simulação de Acoplamento Molecular; Complexos Multiproteicos/química; Água/química; Biologia Computacional; Desoxirribonucleases/química; Heparina/química; Humanos; Concentração de Íons de Hidrogênio; Mutação; Ligação Proteica; Conformação Proteica; Estrutura Terciária de Proteína; Software

Palavras-chave

CAPRI; binding; protein docking; protein interactions

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Carboidratos / Água / Colicinas / Complexos Multiproteicos / Simulação de Acoplamento Molecular Tipo de estudo: Prognostic_studies / Risk_factors_studies Limite: Humans Idioma: En Ano de publicação: 2013 Tipo de documento: Article

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