Space pruning monotonic search for the non-unique probe selection problem.

Pappalardo, Elisa; Ozkok, Beyza Ahlatcioglu; Pardalos, Panos M

Pappalardo, Elisa; Ozkok, Beyza Ahlatcioglu; Pardalos, Panos M.

Afiliação

Pappalardo E; Department of Mathematics and Computer Science, University of Catania, Catania, Italy.
Ozkok BA; Department of Mathematics, Yildiz Technical University, Istanbul, Turkey.
Pardalos PM; Department of Industrial and Systems Engineering, Center for Applied Optimization, University of Florida, Florida, USA.

Int J Bioinform Res Appl ; 10(1): 59-74, 2014.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-24449693

Assuntos

Algoritmos; Sondas de DNA/genética; DNA Viral/genética; Interpretação Estatística de Dados; Hibridização In Situ/métodos; Análise de Sequência de DNA/métodos; Sequência de Bases; Dados de Sequência Molecular

Palavras-chave

DNA fragments; DNA molecules; Monte Carlo algorithm; bacteria; bioinformatics; discrete optimisation; hybrid method; hybridisation; microarrays; probe selection; space pruning monotonic search; target identification; target sequences; viruses

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Algoritmos / DNA Viral / Sondas de DNA / Interpretação Estatística de Dados / Análise de Sequência de DNA / Hibridização In Situ Idioma: En Ano de publicação: 2014 Tipo de documento: Article

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