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Monitoring of four DNA extraction methods upstream of high-throughput sequencing of Anisakidae nematodes.
Seesao, Y; Audebert, C; Verrez-Bagnis, V; Merlin, S; Jérôme, M; Viscogliosi, E; Dei-Cas, E; Aliouat-Denis, C M; Gay, M.
Afiliação
  • Seesao Y; ANSES, Lab. Sécurité des Aliments, Dept Produits de la Pêche et de l'Aquaculture, Boulogne-sur-mer, France; Biologie et Diversité des Pathogènes Eucaryotes Emergents, Institut Pasteur de Lille (IPL), Centre d'Infection et d'Immunité de Lille (CIIL), UMR CNRS 8204, Inserm U1019, Univ. Lille Nord de F
  • Audebert C; Gènes Diffusion, Douai, France; PEGASE-Biosciences, Institut Pasteur de Lille, France.
  • Verrez-Bagnis V; Ifremer, Nantes, France.
  • Merlin S; Gènes Diffusion, Douai, France; PEGASE-Biosciences, Institut Pasteur de Lille, France.
  • Jérôme M; Ifremer, Nantes, France.
  • Viscogliosi E; Biologie et Diversité des Pathogènes Eucaryotes Emergents, Institut Pasteur de Lille (IPL), Centre d'Infection et d'Immunité de Lille (CIIL), UMR CNRS 8204, Inserm U1019, Univ. Lille Nord de France, France.
  • Dei-Cas E; Biologie et Diversité des Pathogènes Eucaryotes Emergents, Institut Pasteur de Lille (IPL), Centre d'Infection et d'Immunité de Lille (CIIL), UMR CNRS 8204, Inserm U1019, Univ. Lille Nord de France, France.
  • Aliouat-Denis CM; Biologie et Diversité des Pathogènes Eucaryotes Emergents, Institut Pasteur de Lille (IPL), Centre d'Infection et d'Immunité de Lille (CIIL), UMR CNRS 8204, Inserm U1019, Univ. Lille Nord de France, France. Electronic address: cecile.aliouat@univ-lille2.fr.
  • Gay M; ANSES, Lab. Sécurité des Aliments, Dept Produits de la Pêche et de l'Aquaculture, Boulogne-sur-mer, France.
J Microbiol Methods ; 102: 69-72, 2014 Jul.
Article em En | MEDLINE | ID: mdl-24845469
Different methods were evaluated to extract DNA from pooled nematodes belonging to Anisakis, Contracaecum, Pseudoterranova and Hysterothylacium genera isolated from edible fish. Pooled DNA extraction is the first and compulsory step to allow the identification of a large number of samples through high-throughput DNA sequencing with drastic time and cost reductions.
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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Ascaridoidea / DNA / Biologia Molecular Limite: Animals Idioma: En Ano de publicação: 2014 Tipo de documento: Article
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